論文の概要: Localization of Malaria Parasites and White Blood Cells in Thick Blood
Smears
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2012.01994v1
- Date: Thu, 3 Dec 2020 15:14:38 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-23 21:33:33.856694
- Title: Localization of Malaria Parasites and White Blood Cells in Thick Blood
Smears
- Title(参考訳): 厚膜血腫におけるマラリア寄生虫と白血球の局在
- Authors: Rose Nakasi, Aminah Zawedde, Ernest Mwebaze, Jeremy Francis Tusubira,
Gilbert Maiga
- Abstract要約: 本研究はマラリア原虫および白血球(WBCs)の局在と数に対するエンドツーエンドアプローチを提案する。
血液スミア画像のスライスデータセットを用いて,得られたデジタル画像を解析するモデルを構築した。
予備的な結果は、我々のディープラーニングアプローチがマラリア原虫とWBCの数を確実に検出し、返却していることを示している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.36646793661301
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Effectively determining malaria parasitemia is a critical aspect in assisting
clinicians to accurately determine the severity of the disease and provide
quality treatment. Microscopy applied to thick smear blood smears is the de
facto method for malaria parasitemia determination. However, manual
quantification of parasitemia is time consuming, laborious and requires
considerable trained expertise which is particularly inadequate in highly
endemic and low resourced areas. This study presents an end-to-end approach for
localisation and count of malaria parasites and white blood cells (WBCs) which
aid in the effective determination of parasitemia; the quantitative content of
parasites in the blood. On a dataset of slices of images of thick blood smears,
we build models to analyse the obtained digital images. To improve model
performance due to the limited size of the dataset, data augmentation was
applied. Our preliminary results show that our deep learning approach reliably
detects and returns a count of malaria parasites and WBCs with a high precision
and recall. We also evaluate our system against human experts and results
indicate a strong correlation between our deep learning model counts and the
manual expert counts (p=0.998 for parasites, p=0.987 for WBCs). This approach
could potentially be applied to support malaria parasitemia determination
especially in settings that lack sufficient Microscopists.
- Abstract(参考訳): マラリア寄生虫症を効果的に判定することは、臨床医が病気の重症度を正確に判定し、高品質な治療を提供するために重要な側面である。
厚いスミアの血液スミアに顕微鏡を適用することはマラリア寄生虫症判定の事実上の方法である。
しかし、寄生虫症の手作業による定量化は時間がかかり、手間がかかり、特に高度で資源の少ない地域では不十分な相当な専門知識を必要とする。
本研究は, マラリア原虫および白血球の局在と定量化のためのエンド・ツー・エンドアプローチであり, 血液中寄生虫の定量値, 寄生虫の定量化に有効であることを示す。
太い血液スメアの画像のスライスのデータセット上に,得られたデジタル画像を分析するモデルを構築した。
データセットのサイズ制限によるモデル性能向上のために,データ拡張を適用した。
予備的な結果から,我々の深層学習アプローチは,高い精度でマラリア原虫とWBCの数を確実に検出し,返却することを示した。
また,人間のエキスパートに対するシステムを評価し,我々のディープラーニングモデル数と手作業のエキスパート数(寄生虫p=0.998,wbcsp=0.987)との間に強い相関関係を示した。
このアプローチはマラリア寄生虫の診断、特に十分なマイクロスコピストを欠いた状況でのサポートに応用できる可能性がある。
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