論文の概要: Discovering Clinically Meaningful Shape Features for the Analysis of
Tumor Pathology Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2012.04878v1
- Date: Wed, 9 Dec 2020 05:56:41 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-16 01:55:23.459844
- Title: Discovering Clinically Meaningful Shape Features for the Analysis of
Tumor Pathology Images
- Title(参考訳): 腫瘍画像解析のための臨床的意義のある形状特徴の発見
- Authors: Esteban Fern\'andez Morales and Cong Zhang and Guanghua Xiao and Chul
Moon and Qiwei Li
- Abstract要約: 腫瘍組織スライドのデジタル画像化は、がん診断の日常的な臨床方法になりつつある。
近年のディープラーニング手法の進歩により,病理画像中の腫瘍領域を大規模に検出し,特徴付けることが可能になった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.864559331994679
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: With the advanced imaging technology, digital pathology imaging of tumor
tissue slides is becoming a routine clinical procedure for cancer diagnosis.
This process produces massive imaging data that capture histological details in
high resolution. Recent developments in deep-learning methods have enabled us
to automatically detect and characterize the tumor regions in pathology images
at large scale. From each identified tumor region, we extracted 30 well-defined
descriptors that quantify its shape, geometry, and topology. We demonstrated
how those descriptor features were associated with patient survival outcome in
lung adenocarcinoma patients from the National Lung Screening Trial (n=143).
Besides, a descriptor-based prognostic model was developed and validated in an
independent patient cohort from The Cancer Genome Atlas Program program
(n=318). This study proposes new insights into the relationship between tumor
shape, geometrical, and topological features and patient prognosis. We provide
software in the form of R code on GitHub:
https://github.com/estfernandez/Slide_Image_Segmentation_and_Extraction.
- Abstract(参考訳): 先端イメージング技術により,腫瘍組織スライドのデジタル病理イメージングは,癌診断のための日常的な臨床手順になりつつある。
このプロセスは、高分解能で組織学的詳細をキャプチャする大規模なイメージングデータを生成する。
近年のディープラーニング技術の進歩により,病理画像中の腫瘍領域を自動的に検出し,特徴付けることが可能になった。
同定された腫瘍領域から,その形状,形状,トポロジーを定量化した30個の明瞭なディスクリプタを抽出した。
全国肺スクリーニング試験 (n=143) の肺腺癌患者において, それらのディスクリプターの特徴が予後に与える影響を実証した。
また、がんゲノムアトラスプログラム(n=318)から独立した患者に対して、ディスクリプタベースの予後予測モデルを開発し、検証した。
本研究は,腫瘍の形状,幾何学的および位相的特徴と患者の予後との関係に関する新たな知見を提案する。
https://github.com/estfernandez/Slide_Image_Segmentation_and_Extraction。
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