論文の概要: Scalable and interpretable rule-based link prediction for large
heterogeneous knowledge graphs
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2012.05750v1
- Date: Thu, 10 Dec 2020 15:36:47 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-15 06:32:19.517138
- Title: Scalable and interpretable rule-based link prediction for large
heterogeneous knowledge graphs
- Title(参考訳): 大規模ヘテロジニアス知識グラフに対するスケーラブルかつ解釈可能なルールベースリンク予測
- Authors: Simon Ott, Laura Graf, Asan Agibetov, Christian Meilicke, Matthias
Samwald
- Abstract要約: スケーラブルなクラスタリングアルゴリズムを通じてルールを集約するSAFRANルールアプリケーションフレームワークを紹介します。
SAFRANは、確立された汎用ベンチマークFB15K-237で完全に解釈可能なリンク予測のための最新の結果を提供します。
これはfb15k-237上で確立された複数の組込みベースのアルゴリズムの結果を超え、openbiolink上のルールベースと組込みベースのアルゴリズムの間のギャップを狭める。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.502717871564512
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Neural embedding-based machine learning models have shown promise for
predicting novel links in biomedical knowledge graphs. Unfortunately, their
practical utility is diminished by their lack of interpretability. Recently,
the fully interpretable, rule-based algorithm AnyBURL yielded highly
competitive results on many general-purpose link prediction benchmarks.
However, its applicability to large-scale prediction tasks on complex
biomedical knowledge bases is limited by long inference times and difficulties
with aggregating predictions made by multiple rules. We improve upon AnyBURL by
introducing the SAFRAN rule application framework which aggregates rules
through a scalable clustering algorithm. SAFRAN yields new state-of-the-art
results for fully interpretable link prediction on the established
general-purpose benchmark FB15K-237 and the large-scale biomedical benchmark
OpenBioLink. Furthermore, it exceeds the results of multiple established
embedding-based algorithms on FB15K-237 and narrows the gap between rule-based
and embedding-based algorithms on OpenBioLink. We also show that SAFRAN
increases inference speeds by up to two orders of magnitude.
- Abstract(参考訳): ニューラルネットワークを用いた機械学習モデルは、バイオメディカル知識グラフにおける新しいリンクを予測することを約束している。
残念ながら、実用性は解釈可能性の欠如によって低下している。
近年、AnyBURLは完全に解釈可能なルールベースのアルゴリズムが、多くの汎用リンク予測ベンチマークで高い競争力を得た。
しかしながら、複雑な生物医学的知識ベースにおける大規模予測タスクへの適用性は、長い推論時間と複数のルールによる予測の集約の困難によって制限される。
スケーラブルなクラスタリングアルゴリズムを通じてルールを集約するsafran rule application frameworkを導入することで、anyburlを改善した。
SAFRANは、確立された汎用ベンチマーク FB15K-237 と大規模バイオメディカルベンチマーク OpenBioLink 上で、完全に解釈可能なリンク予測のための新しい最先端の結果を得る。
さらに、fb15k-237上で確立された複数の組込みベースのアルゴリズムの結果を超え、openbiolink上のルールベースと組込みベースのアルゴリズムのギャップを狭める。
また、SAFRANは最大2桁の推論速度を増大させることを示した。
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