論文の概要: A Hybrid VDV Model for Automatic Diagnosis of Pneumothorax using
Class-Imbalanced Chest X-rays Dataset
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2012.11911v1
- Date: Tue, 22 Dec 2020 10:20:04 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-04-26 23:11:27.517491
- Title: A Hybrid VDV Model for Automatic Diagnosis of Pneumothorax using
Class-Imbalanced Chest X-rays Dataset
- Title(参考訳): 胸部X線データを用いた胸部気胸自動診断のためのハイブリッドVDVモデル
- Authors: Tahira Iqbal, Arslan Shaukat, Usman Akram, Zartasha Mustansar and
Yung-Cheol Byun
- Abstract要約: 現在、利用可能な医療画像データセットのほとんどはクラスアンバランスの問題があります。
まず、クラス不均衡問題に取り組むための既存のアプローチを比較し、そのデータレベル・センスを見つける(つまり、)。
データセットのサブセットのアンサンブル) 他のアプローチよりも優れています。
提案手法はSIIM ACR Pneumothorax データセットと NIH Chest X-ray データセット(RS-NIH)のランダムサンプルを用いて検証した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Pneumothorax, a life threatening disease, needs to be diagnosed immediately
and efficiently. The prognosis in this case is not only time consuming but also
prone to human errors. So an automatic way of accurate diagnosis using chest
X-rays is the utmost requirement. To-date, most of the available medical images
datasets have class-imbalance issue. The main theme of this study is to solve
this problem along with proposing an automated way of detecting pneumothorax.
We first compare the existing approaches to tackle the class-imbalance issue
and find that data-level-ensemble (i.e. ensemble of subsets of dataset)
outperforms other approaches. Thus, we propose a novel framework named as VDV
model, which is a complex model-level-ensemble of data-level-ensembles and uses
three convolutional neural networks (CNN) including VGG16, VGG-19 and
DenseNet-121 as fixed feature extractors. In each data-level-ensemble features
extracted from one of the pre-defined CNN are fed to support vector machine
(SVM) classifier, and output from each data-level-ensemble is calculated using
voting method. Once outputs from the three data-level-ensembles with three
different CNN architectures are obtained, then, again, voting method is used to
calculate the final prediction. Our proposed framework is tested on SIIM ACR
Pneumothorax dataset and Random Sample of NIH Chest X-ray dataset (RS-NIH). For
the first dataset, 85.17% Recall with 86.0% Area under the Receiver Operating
Characteristic curve (AUC) is attained. For the second dataset, 90.9% Recall
with 95.0% AUC is achieved with random split of data while 85.45% recall with
77.06% AUC is obtained with patient-wise split of data. For RS-NIH, the
obtained results are higher as compared to previous results from literature
However, for first dataset, direct comparison cannot be made, since this
dataset has not been used earlier for Pneumothorax classification.
- Abstract(参考訳): 生命を脅かす疾患である気胸は、迅速かつ効率的に診断する必要がある。
この場合の予後は時間を消費するだけでなく、人間の誤りも生じやすい。
そのため、胸部X線による自動診断が最優先事項である。
現在利用可能な医療画像データセットのほとんどは、クラスバランスの問題を抱えている。
本研究の主なテーマは気胸の自動検出法の提案とともにこの問題を解決することである。
まず、クラス不均衡の問題に対処するための既存のアプローチを比較し、データレベルのアンサンブルを見つけます。
データセットのサブセットのアンサンブル)は他のアプローチよりも優れています。
そこで本研究では,VGG16,VGG-19,DenseNet-121といった3つの畳み込みニューラルネットワークを固定特徴抽出器として用いた,複雑なデータレベルのアンサンブルであるVDVモデルを提案する。
予め定義されたCNNの1つから抽出された各データレベルアンサンブル特徴をベクトルマシン(SVM)分類器に供給し、投票方法を用いて各データレベルアンサンブルから出力を算出する。
3つの異なるCNNアーキテクチャを持つ3つのデータレベルアンサンブルから出力を得ると、再度投票法を用いて最終的な予測を計算する。
提案手法はSIIM ACR Pneumothorax データセットと NIH Chest X-ray データセットのランダムサンプルを用いて検証した。
第1のデータセットでは、受信者動作特性曲線(auc)の下85.17%の領域をリコールする。
第2のデータセットでは、95.0%のAUCで90.9%のリコールがランダムなデータ分割で達成され、85.45%のリコールと77.06%のAUCで患者のデータ分割によって得られる。
RS-NIHの場合,得られた結果は文献による結果と比較して高いが,第1のデータセットでは,このデータセットはPneumothorax分類に使用されていないため,直接比較はできない。
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