論文の概要: Synthetic Generation of Three-Dimensional Cancer Cell Models from
Histopathological Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2101.11600v2
- Date: Mon, 8 Feb 2021 07:22:31 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-03-13 19:35:50.798791
- Title: Synthetic Generation of Three-Dimensional Cancer Cell Models from
Histopathological Images
- Title(参考訳): 病理組織像からの3次元癌細胞モデルの合成
- Authors: Yoav Alon and Xiang Yu and Huiyu Zhou
- Abstract要約: 本論文では,発電機識別パターンに基づく合成3次元ヒストロジーモデル生成のための新しい枠組みを提案する。
提案アルゴリズムは、低いフリーチェット・インセプションスコアなどの比較評価指標において、高い定量的および定性的な合成を実現する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 19.778965983551114
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Synthetic generation of three-dimensional cell models from histopathological
images aims to enhance understanding of cell mutation, and progression of
cancer, necessary for clinical assessment and optimal treatment. Classical
reconstruction algorithms based on image registration of consecutive slides of
stained tissues are prone to errors and often not suitable for the training of
three-dimensional segmentation algorithms. We propose a novel framework to
generate synthetic three-dimensional histological models based on a
generator-discriminator pattern optimizing constrained features that construct
a 3D model via a Blender interface exploiting smooth shape continuity typical
for biological specimens. To capture the spatial context of entire cell
clusters we deploy a novel deep topology transformer that implements and
attention mechanism on cell group images to extract features for the frozen
feature decoder. The proposed algorithms achieves high quantitative and
qualitative synthesis evident in comparative evaluation metrics such as a low
Frechet-Inception scores.
- Abstract(参考訳): 組織病理学的画像から三次元細胞モデルの合成生成は、臨床評価および最適な治療に必要な細胞突然変異の理解、および癌の進行を促進することを目的とする。
染色組織の連続スライス画像の登録に基づく古典的再構成アルゴリズムは誤りが多く,三次元セグメンテーションアルゴリズムの訓練には適さないことが多い。
生物検体に典型的な滑らかな形状連続性を利用したBlenderインタフェースを用いて3次元モデルを構成する制約特徴を最適化するジェネレータ・ディスクリミネータパターンに基づく合成三次元組織モデルを生成する新しいフレームワークを提案する。
細胞クラスタ全体の空間的コンテキストをキャプチャするために、細胞群画像に注意メカニズムを実装し、凍結特徴デコーダの機能を抽出する新しいディープトポロジトランスをデプロイします。
提案アルゴリズムは、低いフリーチェット・インセプションスコアなどの比較評価指標において、高い定量的および定性的な合成を実現する。
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