論文の概要: Initial condition assessment for reaction-diffusion glioma growth
models: A translational MRI/histology (in)validation study
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2102.01719v1
- Date: Tue, 2 Feb 2021 19:21:48 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-02-04 17:03:38.199184
- Title: Initial condition assessment for reaction-diffusion glioma growth
models: A translational MRI/histology (in)validation study
- Title(参考訳): re-diffusion glioma growth modelの初期条件評価:translational mri/histology (in)validation study
- Authors: Corentin Martens, Laetitia Lebrun, Christine Decaestecker, Thomas
Vandamme, Yves-R\'emi Van Eycke, Antonin Rovai, Thierry Metens, Olivier
Debeir, Serge Goldman, Isabelle Salmon, Gaetan Van Simaeys
- Abstract要約: 反応拡散成長モデルでは、MRIで見るマージンを超えるグリオーマ細胞の浸潤を外挿するために何十年も提案されてきた。
腫瘍細胞密度関数とMRIで見られる異常のアウトラインを関連付ける研究がいくつか提案されているが、基礎となる仮定は確認されていない。
本研究は、グリオ芽腫を有する非手術脳の立体的組織学的解析により、これらの仮定を検証することを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.7183079620559387
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Diffuse gliomas are highly infiltrative tumors whose early diagnosis and
follow-up usually rely on magnetic resonance imaging (MRI). However, the
limited sensitivity of this technique makes it impossible to directly assess
the extent of the glioma cell invasion, leading to sub-optimal treatment
planing. Reaction-diffusion growth models have been proposed for decades to
extrapolate glioma cell infiltration beyond margins visible on MRI and predict
its spatial-temporal evolution. These models nevertheless require an initial
condition, that is the tumor cell density values at every location of the brain
at diagnosis time. Several works have proposed to relate the tumor cell density
function to abnormality outlines visible on MRI but the underlying assumptions
have never been verified so far. In this work we propose to verify these
assumptions by stereotactic histological analysis of a non-operated brain with
glioblastoma using a tailored 3D-printed slicer. Cell density maps are computed
from histological slides using a deep learning approach. The density maps are
then registered to a postmortem MR image and related to an MR-derived geodesic
distance map to the tumor core. The relation between the edema outlines visible
on T2 FLAIR MRI and the distance to the core is also investigated. Our results
suggest that (i) the previously suggested exponential decrease of the tumor
cell density with the distance to the tumor core is not unreasonable but (ii)
the edema outlines may in general not correspond to a cell density iso-contour
and (iii) the commonly adopted tumor cell density value at these outlines is
likely overestimated. These findings highlight the limitations of using
conventional MRI to derive glioma cell density maps and point out the need of
validating other methods to initialize reaction-diffusion growth models and
make them usable in clinical practice.
- Abstract(参考訳): 拡散性グリオーマは高浸潤性腫瘍であり、早期診断とフォローアップは通常磁気共鳴画像(MRI)に依存する。
しかし、この技術の感度が限られているため、グリオーマ細胞浸潤の程度を直接評価することは不可能であり、最適以下の治療計画につながる。
反応拡散成長モデルは、MRIで見るマージンを超えてグリオーマ細胞の浸潤を外挿し、その時空間的進化を予測するために何十年も提案されてきた。
これらのモデルは、診断時に脳のあらゆる位置における腫瘍細胞密度値である初期状態を必要とする。
腫瘍細胞密度関数とMRIで見られる異常のアウトラインを関連付ける研究がいくつか提案されているが、基礎となる仮定は確認されていない。
本研究では,3Dプリンティングスライサーを用いたグリオ芽腫を有する非手術脳の立体的組織学的解析により,これらの仮定を検証することを提案する。
細胞密度マップは、深層学習アプローチを用いて、組織学的スライドから計算される。
次に、密度マップは、死後MR画像に登録され、腫瘍コアへのMR由来測地距離マップと関連付けられる。
T2 FLAIR MRIで見られる浮腫アウトラインとコアの距離との関係についても検討した。
以上の結果から, (i) 腫瘍コアまでの距離で腫瘍細胞密度が指数関数的に減少することは理にかなわないが, (ii) 浮腫アウトラインは一般に細胞密度 iso-contour と一致せず, (iii) これらのアウトラインで一般的に採用されている腫瘍細胞密度値が過大評価される可能性が示唆された。
これらの知見は、従来のmriを用いたグリオーマ細胞密度マップの導出の限界を浮き彫りにして、他の方法による反応拡散成長モデルの初期化と臨床応用の必要性を指摘している。
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