論文の概要: Learn-Morph-Infer: a new way of solving the inverse problem for brain
tumor modeling
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2111.04090v1
- Date: Sun, 7 Nov 2021 13:45:35 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-11-09 17:52:32.697186
- Title: Learn-Morph-Infer: a new way of solving the inverse problem for brain
tumor modeling
- Title(参考訳): learn-morph-infer:脳腫瘍モデルにおける逆問題を解く新しい方法
- Authors: Ivan Ezhov, Kevin Scibilia, Katharina Franitza, Felix Steinbauer,
Suprosanna Shit, Lucas Zimmer, Jana Lipkova, Florian Kofler, Johannes
Paetzold, Luca Canalini, Diana Waldmannstetter, Martin Menten, Marie Metz,
Benedikt Wiestler, and Bjoern Menze
- Abstract要約: 本稿では,T1GdとFLAIR MRIから患者特異的な脳腫瘍の空間分布を推定する手法を提案する。
itLearn-Morph-Inferと組み合わせたこの手法は、広く利用可能なハードウェア上で、数分のオーダーでリアルタイムのパフォーマンスを実現する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.1214822628210914
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Current treatment planning of patients diagnosed with brain tumor could
significantly benefit by accessing the spatial distribution of tumor cell
concentration. Existing diagnostic modalities, such as magnetic-resonance
imaging (MRI), contrast sufficiently well areas of high cell density. However,
they do not portray areas of low concentration, which can often serve as a
source for the secondary appearance of the tumor after treatment. Numerical
simulations of tumor growth could complement imaging information by providing
estimates of full spatial distributions of tumor cells. Over recent years a
corpus of literature on medical image-based tumor modeling was published. It
includes different mathematical formalisms describing the forward tumor growth
model. Alongside, various parametric inference schemes were developed to
perform an efficient tumor model personalization, i.e. solving the inverse
problem. However, the unifying drawback of all existing approaches is the time
complexity of the model personalization that prohibits a potential integration
of the modeling into clinical settings. In this work, we introduce a
methodology for inferring patient-specific spatial distribution of brain tumor
from T1Gd and FLAIR MRI medical scans. Coined as \textit{Learn-Morph-Infer} the
method achieves real-time performance in the order of minutes on widely
available hardware and the compute time is stable across tumor models of
different complexity, such as reaction-diffusion and
reaction-advection-diffusion models. We believe the proposed inverse solution
approach not only bridges the way for clinical translation of brain tumor
personalization but can also be adopted to other scientific and engineering
domains.
- Abstract(参考訳): 脳腫瘍と診断された患者の現在の治療計画は、腫瘍細胞濃度の空間的分布にアクセスすることで著しく有益である。
磁気共鳴イメージング(MRI)のような既存の診断法は、高い細胞密度の十分な良い領域と対比する。
しかし、低濃度の領域を描写せず、治療後の二次的な腫瘍の出現の源となることが多い。
腫瘍増殖の数値シミュレーションは、腫瘍細胞の全空間分布の推定を提供することで、画像情報を補完することができる。
近年、医用画像に基づく腫瘍モデリングに関する文献のコーパスが出版された。
前方腫瘍成長モデルを記述する様々な数学的形式を含んでいる。
同時に,腫瘍モデルパーソナライゼーション,すなわち逆問題の解決を行うために,様々なパラメトリック推論手法が開発された。
しかしながら、既存のすべてのアプローチの欠点は、モデルパーソナライゼーションの時間的複雑さであり、モデルが臨床設定に潜在的に統合されることを禁止している。
本研究では,T1GdとFLAIR MRIによる脳腫瘍の患者特異的空間分布を推定する手法を提案する。
この方法は \textit{learn-morph-infer} と呼ばれ、広く利用可能なハードウェア上で数分単位でリアルタイムのパフォーマンスを達成し、反応拡散モデルや反応吸着拡散モデルのような異なる複雑性の腫瘍モデル間で計算時間は安定である。
提案手法は脳腫瘍のパーソナライズを臨床的に翻訳する方法を橋渡しするだけでなく,他の科学的・工学的領域にも適用できると考えている。
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