論文の概要: Drug Package Recommendation via Interaction-aware Graph Induction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2102.03577v1
- Date: Sat, 6 Feb 2021 12:51:00 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-02-09 15:56:04.143776
- Title: Drug Package Recommendation via Interaction-aware Graph Induction
- Title(参考訳): 相互作用認識グラフ誘導による薬物包装勧告
- Authors: Zhi Zheng, Chao Wang, Tong Xu, Dazhong Shen, Penggang Qin, Baoxing
Huai, Tongzhu Liu, Enhong Chen
- Abstract要約: 本稿では,DPR on Weighted Graph (DPR-WG) とDPR on Attributed Graph (DPR-AG) の2つのバリエーションを持つ新しいDPRフレームワークを提案する。
詳しくは、マスク層を用いて患者の状態の影響を捉え、最終グラフ誘導タスクにグラフニューラルネットワーク(GNN)を利用してパッケージを埋め込む。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 44.493214829186115
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Recent years have witnessed the rapid accumulation of massive electronic
medical records (EMRs), which highly support the intelligent medical services
such as drug recommendation. However, prior arts mainly follow the traditional
recommendation strategies like collaborative filtering, which usually treat
individual drugs as mutually independent, while the latent interactions among
drugs, e.g., synergistic or antagonistic effect, have been largely ignored. To
that end, in this paper, we target at developing a new paradigm for drug
package recommendation with considering the interaction effect within drugs, in
which the interaction effects could be affected by patient conditions.
Specifically, we first design a pre-training method based on neural
collaborative filtering to get the initial embedding of patients and drugs.
Then, the drug interaction graph will be initialized based on medical records
and domain knowledge. Along this line, we propose a new Drug Package
Recommendation (DPR) framework with two variants, respectively DPR on Weighted
Graph (DPR-WG) and DPR on Attributed Graph (DPR-AG) to solve the problem, in
which each the interactions will be described as signed weights or attribute
vectors. In detail, a mask layer is utilized to capture the impact of patient
condition, and graph neural networks (GNNs) are leveraged for the final graph
induction task to embed the package. Extensive experiments on a real-world data
set from a first-rate hospital demonstrate the effectiveness of our DPR
framework compared with several competitive baseline methods, and further
support the heuristic study for the drug package generation task with adequate
performance.
- Abstract(参考訳): 近年は、医薬品推奨などのインテリジェントな医療サービスを支援する大規模な電子医療記録(EMR)が急速に蓄積されているのを目撃している。
しかし、先行技術は主に、個々の薬物を互いに独立したものとして扱う共同フィルタリングのような従来の推奨戦略に従っており、薬物間の潜伏相互作用(例えば、相乗効果や反抗作用)は無視されている。
そこで本研究では, 薬物の相互作用効果を考慮し, 薬物パッケージレコメンデーションのための新たなパラダイムを開発することを目的としている。
具体的には、患者や薬物の初期埋め込みを得るために、神経協調フィルタリングに基づく事前トレーニング手法を最初に設計しました。
次に、薬物相互作用グラフは、医療記録とドメイン知識に基づいて初期化される。
本稿では,dprを重み付きグラフ (dpr-wg) に,dprを重み付きグラフ (dpr-ag) にそれぞれdprを,dprを重み付きグラフ (dpr-ag) にそれぞれdprを2種類に分けた新しいdprフレームワークを提案し,それぞれの相互作用を符号付き重み付きまたは属性ベクターとして記述する。
詳細には、マスク層を使用して患者状態の影響を捉え、最終的なグラフ誘導タスクのためにグラフニューラルネットワーク(GNN)を利用してパッケージを埋め込む。
一流病院からの現実世界のデータセットに関する広範な実験は、いくつかの競争力のあるベースライン方法と比較して、当社のDPRフレームワークの有効性を実証し、適切なパフォーマンスで薬物パッケージ生成タスクのヒューリスティック研究をさらに支援します。
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