論文の概要: BEDS: Bagging ensemble deep segmentation for nucleus segmentation with
testing stage stain augmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2102.08990v1
- Date: Wed, 17 Feb 2021 19:34:41 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-02-19 14:35:11.538264
- Title: BEDS: Bagging ensemble deep segmentation for nucleus segmentation with
testing stage stain augmentation
- Title(参考訳): BEDS:Baging ensemble Deep segmentation for nucleus segmentation with test stage stain augmentation
- Authors: Xing Li, Haichun Yang, Jiaxin He, Aadarsh Jha, Agnes B. Fogo, Lee E.
Wheless, Shilin Zhao, Yuankai Huo
- Abstract要約: ブートストラップ集約(bootstrap aggregating)は、弱い学習者を集めて強力な学習者になるための、標準的なアンサンブルアルゴリズムである。
本論文では,複数のU-Netを部分訓練データで訓練し,病理画像上に高密度核を分割するための簡易バギングアンサンブルディープセグメンテーション(BED)法を提案する。
本研究の貢献は,(1)核セグメンテーションのための自己センブル学習フレームワークの開発,(2)自己センブル学習によるテストステージ強化の集約,(3)自己センブルとテストステージ染色強化が優れたセグメンテーション性能のための補完的戦略であるという考えの解明,の3つである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.80053986075991
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Reducing outcome variance is an essential task in deep learning based medical
image analysis. Bootstrap aggregating, also known as bagging, is a canonical
ensemble algorithm for aggregating weak learners to become a strong learner.
Random forest is one of the most powerful machine learning algorithms before
deep learning era, whose superior performance is driven by fitting bagged
decision trees (weak learners). Inspired by the random forest technique, we
propose a simple bagging ensemble deep segmentation (BEDs) method to train
multiple U-Nets with partial training data to segment dense nuclei on
pathological images. The contributions of this study are three-fold: (1)
developing a self-ensemble learning framework for nucleus segmentation; (2)
aggregating testing stage augmentation with self-ensemble learning; and (3)
elucidating the idea that self-ensemble and testing stage stain augmentation
are complementary strategies for a superior segmentation performance.
Implementation Detail: https://github.com/xingli1102/BEDs.
- Abstract(参考訳): 結果のばらつきを減らすことは、深層学習に基づく医療画像分析に不可欠な課題です。
ブートストラップ集約(Bootstrap aggregating)は、弱い学習者が強力な学習者になるための標準アンサンブルアルゴリズムである。
ランダムフォレストは、ディープラーニング時代以前の最も強力な機械学習アルゴリズムの1つであり、その優れたパフォーマンスは、袋詰めされた決定木(弱い学習者)によって駆動されます。
ランダムフォレスト手法に触発されて,複数のu-netを訓練データで訓練し,密度の高い核を病理画像に分割する簡易なバグングアンサンブル深層セグメンテーション (beds) 法を提案する。
本研究の貢献は,(1)核セグメンテーションのための自己センブル学習フレームワークの開発,(2)自己センブル学習によるテストステージ強化の集約,(3)自己センブルとテストステージ染色強化が優れたセグメンテーション性能のための補完的戦略であるという考えの解明,の3つである。
実装の詳細: https://github.com/xingli1102/BEDs。
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