論文の概要: Histo-fetch -- On-the-fly processing of gigapixel whole slide images
simplifies and speeds neural network training
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2102.11433v1
- Date: Tue, 23 Feb 2021 00:40:26 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-02-25 05:59:21.272987
- Title: Histo-fetch -- On-the-fly processing of gigapixel whole slide images
simplifies and speeds neural network training
- Title(参考訳): histo-fetch -- ギガピクセル全体のスライド画像のオンザフライ処理がニューラルネットワークトレーニングを単純化し、高速化する
- Authors: Brendon Lutnick, Leema Krishna Murali, Brandon Ginley, and Pinaki
Sarder
- Abstract要約: We create a custom pipeline (histo-fetch) to improve random patch and labels from pathology whole slide image (WSIs)
ネットワークトレーニング中に必要に応じてこれらのパッチをプリフェッチし、切り欠き/切り欠きの必要性を回避します。
本稿では,一般的なネットワークCycleGANとProGANを用いて,人工的な染料転送と画像生成を行うパイプラインの有用性を実証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We created a custom pipeline (histo-fetch) to efficiently extract random
patches and labels from pathology whole slide images (WSIs) for input to a
neural network on-the-fly. We prefetch these patches as needed during network
training, avoiding the need for WSI preparation such as chopping/tiling. We
demonstrate the utility of this pipeline to perform artificial stain transfer
and image generation using the popular networks CycleGAN and ProGAN,
respectively.
- Abstract(参考訳): ニューラルネットワークへの入力を行うために,病理全体スライド画像(wsis)からランダムパッチやラベルを効率的に抽出するカスタムパイプライン(histo-fetch)を開発した。
我々は、ネットワークトレーニング中に必要に応じてこれらのパッチをプリフェッチし、切り欠きや切り欠きなどのwsi準備の必要性を回避した。
本稿では,一般的なネットワークCycleGANとProGANを用いて,人工的な染料転送と画像生成を行うパイプラインの有用性を実証する。
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