論文の概要: COVID-19 detection using chest X-rays: is lung segmentation important
for generalization?
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2104.06176v1
- Date: Mon, 12 Apr 2021 09:06:28 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-04-14 13:37:22.063509
- Title: COVID-19 detection using chest X-rays: is lung segmentation important
for generalization?
- Title(参考訳): 胸部X線を用いたCOVID-19検出 : 肺分画は一般化に重要であるか?
- Authors: Pedro R. A. S. Bassi, Romis Attux
- Abstract要約: 深部ニューラルネットワーク(DNN)は、比較的小さく混合されたデータセットを使用して、胸部X線をCOVID-19、正常または肺炎として分類するために訓練された。
外部データセットとLRP分析のパフォーマンスは、DNNを小さな混合データセットでトレーニングし、COVID-19を検出することを示唆している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.198144010381572
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: We evaluated the generalization capability of deep neural networks (DNNs),
trained to classify chest X-rays as COVID-19, normal or pneumonia, using a
relatively small and mixed dataset.
We proposed a DNN architecture to perform lung segmentation and
classification. It stacks a segmentation module (U-Net), an original
intermediate module and a classification module (DenseNet201). We compared it
to a DenseNet201.
To evaluate generalization, we tested the DNNs with an external dataset (from
distinct localities) and used Bayesian inference to estimate the probability
distributions of performance metrics, like F1-Score.
Our proposed DNN achieved 0.917 AUC on the external test dataset, and the
DenseNet, 0.906. Bayesian inference indicated mean accuracy of 76.1% and
[0.695, 0.826] 95% HDI with segmentation and, without segmentation, 71.7% and
[0.646, 0.786].
We proposed a novel DNN evaluation technique, using Layer-wise Relevance
Propagation (LRP) and the Brixia score. LRP heatmaps indicated that areas where
radiologists found strong COVID-19 symptoms and attributed high Brixia scores
are the most important for the stacked DNN classification.
External validation showed smaller accuracies than internal validation,
indicating dataset bias, which segmentation reduces. Performance in the
external dataset and LRP analysis suggest that DNNs can be trained in small and
mixed datasets and detect COVID-19.
- Abstract(参考訳): 比較的小さく混合されたデータセットを用いて,胸部x線をcovid-19,正常,肺炎と分類するように訓練された深層ニューラルネットワーク(dnn)の一般化能を評価した。
肺の分節と分類を行うためのDNNアーキテクチャを提案する。
セグメンテーションモジュール(U-Net)、オリジナルの中間モジュール、分類モジュール(DenseNet201)をスタックする。
DenseNet201と比較しました。
一般化を評価するために,外部データセットを用いてdnnをテストし,ベイズ推論を用いてf1-scoreなどの性能指標の確率分布を推定した。
提案したDNNは外部テストデータセットで0.917 AUC, DenseNetでは0.906。
ベイズ推定では, セグメンテーションによる平均精度は76.1%, [0.695, 0.826] 95%で, セグメンテーションは71.7%, [0.646, 0.786] であった。
我々は,レイヤワイド関連伝搬(LRP)とブリキシアスコアを用いた新しいDNN評価手法を提案する。
LRPヒートマップは、放射線学者が強い新型コロナウイルスの症状と高いブリキシアスコアを報告した地域が、DNN分類において最も重要な地域であることを示唆している。
外部検証では、内部検証よりも精度が低く、データセットバイアスを示し、セグメンテーションが減少する。
外部データセットとLRP分析のパフォーマンスは、DNNを小さな混合データセットでトレーニングし、COVID-19を検出することを示唆している。
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