論文の概要: A Deep Learning Based Workflow for Detection of Lung Nodules With Chest
Radiograph
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2112.10184v2
- Date: Tue, 21 Dec 2021 10:09:07 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-12-22 11:25:44.122877
- Title: A Deep Learning Based Workflow for Detection of Lung Nodules With Chest
Radiograph
- Title(参考訳): 胸部x線写真を用いた肺結節検出のための深層学習ワークフロー
- Authors: Yang Tai, Yu-Wen Fang (Same contribution), Fang-Yi Su, and Jung-Hsien
Chiang
- Abstract要約: CXRから肺領域を識別するセグメンテーションモデルを構築し,それを16個のパッチに分割した。
これらのラベル付きパッチを使用して、ディープニューラルネットワーク(DNN)モデルを微調整し、パッチをポジティブまたはネガティブに分類する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: PURPOSE: This study aimed to develop a deep learning-based tool to detect and
localize lung nodules with chest radiographs(CXRs). We expected it to enhance
the efficiency of interpreting CXRs and reduce the possibilities of delayed
diagnosis of lung cancer.
MATERIALS AND METHODS: We collected CXRs from NCKUH database and VBD, an
open-source medical image dataset, as our training and validation data. A
number of CXRs from the Ministry of Health and Welfare(MOHW) database served as
our test data. We built a segmentation model to identify lung areas from CXRs,
and sliced them into 16 patches. Physicians labeled the CXRs by clicking the
patches. These labeled patches were then used to train and fine-tune a deep
neural network(DNN) model, classifying the patches as positive or negative.
Finally, we test the DNN model with the lung patches of CXRs from MOHW.
RESULTS: Our segmentation model identified the lung regions well from the
whole CXR. The Intersection over Union(IoU) between the ground truth and the
segmentation result was 0.9228. In addition, our DNN model achieved a
sensitivity of 0.81, specificity of 0.82, and AUROC of 0.869 in 98 of 125
cases. For the other 27 difficult cases, the sensitivity was 0.54, specificity
0.494, and AUROC 0.682. Overall, we obtained a sensitivity of 0.78, specificity
of 0.79, and AUROC 0.837.
CONCLUSIONS: Our two-step workflow is comparable to state-of-the-art
algorithms in the sensitivity and specificity of localizing lung nodules from
CXRs. Notably, our workflow provides an efficient way for specialists to label
the data, which is valuable for relevant researches because of the relative
rarity of labeled medical image data.
- Abstract(参考訳): PURPOSE:胸部X線写真(CXR)による肺結節の検出と局所化を目的とした深層学習ツールの開発を目的とした。
我々は,CXRの解釈効率を高め,肺癌の診断遅延の可能性を低減することを期待した。
資料と方法:NCKUHデータベースとオープンソースの医療画像データセットであるVBDからCXRをトレーニングおよび検証データとして収集した。
厚生労働省(MOHW)データベースのCXRがテストデータとして役立ちました。
CXRから肺領域を識別するセグメンテーションモデルを構築し,それを16個のパッチに分割した。
医師はパッチをクリックしてCXRにラベルを付けた。
これらのラベル付きパッチは、ディープニューラルネットワーク(dnn)モデルのトレーニングと微調整に使用され、パッチを正または負に分類した。
最後に,MOHWのCXRの肺パッチを用いてDNNモデルを検証した。
結果: 分画モデルはcxr全体から肺領域をよく同定した。
接地真理と分断結果の間の連合(IoU)のインターセクションは0.9228である。
さらに, 125例中98例において, DNNモデルは0.81, 0.82, AUROCは0.869であった。
他の27例では感度0.54、特異性0.494、AUROC 0.682であった。
感度0.78,特異性0.79,AUROC0.837を得た。
CONCLUSIONS: 我々の2段階のワークフローは、CXRから肺結節を局在させる感度と特異性において最先端のアルゴリズムに匹敵する。
特に,本ワークフローは,ラベル付き医用画像データの相対的希少性から,関連研究に有用なラベル付けを行うための効率的な方法である。
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