論文の概要: CNN AE: Convolution Neural Network combined with Autoencoder approach to
detect survival chance of COVID 19 patients
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2104.08954v1
- Date: Sun, 18 Apr 2021 20:31:17 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-04-20 13:35:11.282522
- Title: CNN AE: Convolution Neural Network combined with Autoencoder approach to
detect survival chance of COVID 19 patients
- Title(参考訳): CNN AE:畳み込みニューラルネットワークとオートエンコーダの併用による新型コロナウイルス19人の生存率検出
- Authors: Fahime Khozeimeh, Danial Sharifrazi, Navid Hoseini Izadi, Javad
Hassannataj Joloudari, Afshin Shoeibi, Roohallah Alizadehsani, Juan M.
Gorriz, Sadiq Hussain, Zahra Alizadeh Sani, Hossein Moosaei, Abbas Khosravi,
Saeid Nahavandi, Sheikh Mohammed Shariful Islam
- Abstract要約: 臨床情報に基づいて訓練したCNNを用いて、新型コロナウイルス患者の生存率を予測する新しいCNN-AE法を提案する。
予測精度をさらに高めるために、CNNをオートエンコーダと組み合わせて使用します。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.121959969774327
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: In this paper, we propose a novel method named CNN-AE to predict survival
chance of COVID-19 patients using a CNN trained on clinical information. To
further increase the prediction accuracy, we use the CNN in combination with an
autoencoder. Our method is one of the first that aims to predict survival
chance of already infected patients. We rely on clinical data to carry out the
prediction. The motivation is that the required resources to prepare CT images
are expensive and limited compared to the resources required to collect
clinical data such as blood pressure, liver disease, etc. We evaluate our
method on a publicly available clinical dataset of deceased and recovered
patients which we have collected. Careful analysis of the dataset properties is
also presented which consists of important features extraction and correlation
computation between features. Since most of COVID-19 patients are usually
recovered, the number of deceased samples of our dataset is low leading to data
imbalance. To remedy this issue, a data augmentation procedure based on
autoencoders is proposed. To demonstrate the generality of our augmentation
method, we train random forest and Na\"ive Bayes on our dataset with and
without augmentation and compare their performance. We also evaluate our method
on another dataset for further generality verification. Experimental results
reveal the superiority of CNN-AE method compared to the standard CNN as well as
other methods such as random forest and Na\"ive Bayes. COVID-19 detection
average accuracy of CNN-AE is 96.05% which is higher than CNN average accuracy
of 92.49%. To show that clinical data can be used as a reliable dataset for
COVID-19 survival chance prediction, CNN-AE is compared with a standard CNN
which is trained on CT images.
- Abstract(参考訳): 本稿では,臨床情報に基づいて訓練したCNNを用いて,新型コロナウイルス患者の生存率を予測する新しいCNN-AE法を提案する。
さらに, 予測精度を高めるために, オートエンコーダと組み合わせてcnnを用いた。
すでに感染した患者の生存率を予測するための最初の方法の一つである。
我々はその予測を行うために臨床データに頼る。
モチベーションは、ct画像を作成するために必要なリソースは、血圧、肝疾患などの臨床データを集めるのに必要なリソースに比べて高価で限られていることである。
当院で収集した死亡者および回復者の臨床データを用いて,本手法を評価した。
また、重要な特徴抽出と特徴間の相関計算からなるデータセット特性の注意深い分析も提示する。
新型コロナウイルス(COVID-19)患者のほとんどが通常回復しているため、データセットの死亡サンプル数は少ないため、データの不均衡につながる。
この問題を改善するために,オートエンコーダに基づくデータ拡張手順を提案する。
拡張手法の汎用性を示すため,データセット上で無作為な森林とNa\"ive Bayesを増補なしで訓練し,それらの性能を比較した。
また,本手法を他のデータセット上で評価し,さらなる一般性検証を行う。
実験の結果,標準CNNに比べてCNN-AE法の方が優れており,また無作為林やナシブベイズなど他の手法も優れていることがわかった。
CNN-AEの平均精度は96.05%であり、CNNの平均精度は92.49%である。
臨床データがcovid-19生存確率予測の信頼できるデータセットとして使用できることを示すために、cnn-aeをct画像で訓練された標準cnnと比較する。
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