論文の概要: High-dimensional near-optimal experiment design for drug discovery via
Bayesian sparse sampling
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2104.11834v1
- Date: Fri, 23 Apr 2021 22:43:16 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-04-27 14:23:06.383559
- Title: High-dimensional near-optimal experiment design for drug discovery via
Bayesian sparse sampling
- Title(参考訳): ベイジアンスパースサンプリングによる薬物発見のための高次元近接最適実験設計
- Authors: Hannes Eriksson, Christos Dimitrakakis, Lars Carlsson
- Abstract要約: 我々は,スパースツリー探索を用いた非筋電図的精巧な探索手法がトンプソンサンプリングのような方法よりも明らかに有利であることを示した。
薬物毒性の既存および合成データセットに対するアプローチの有意な優位性を実証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.7108061411642685
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: We study the problem of performing automated experiment design for drug
screening through Bayesian inference and optimisation. In particular, we
compare and contrast the behaviour of linear-Gaussian models and Gaussian
processes, when used in conjunction with upper confidence bound algorithms,
Thompson sampling, or bounded horizon tree search. We show that non-myopic
sophisticated exploration techniques using sparse tree search have a distinct
advantage over methods such as Thompson sampling or upper confidence bounds in
this setting. We demonstrate the significant superiority of the approach over
existing and synthetic datasets of drug toxicity.
- Abstract(参考訳): ベイジアン推論と最適化による薬物スクリーニングのための自動実験設計の課題について検討する。
特に,線形ガウスモデルとガウス過程の挙動を,高信頼度有界アルゴリズム,トンプソンサンプリング,あるいは有界地平木探索と組み合わせて比較・対比する。
スパースツリーサーチを用いた非神秘的高度な探索手法は,トンプソンサンプリングや高信頼境界といった手法に対して,明らかに有利であることを示す。
薬物毒性の既存および合成データセットに対するアプローチの顕著な優位性を示す。
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