論文の概要: Data Augmentation in High Dimensional Low Sample Size Setting Using a
Geometry-Based Variational Autoencoder
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.00026v1
- Date: Fri, 30 Apr 2021 18:10:33 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2021-05-04 14:20:15.435447
- Title: Data Augmentation in High Dimensional Low Sample Size Setting Using a
Geometry-Based Variational Autoencoder
- Title(参考訳): 幾何学に基づく変分オートエンコーダを用いた高次元低サンプルサイズ設定におけるデータ拡張
- Authors: Cl\'ement Chadebec, Elina Thibeau-Sutre, Ninon Burgos and St\'ephanie
Allassonni\`ere
- Abstract要約: 幾何に基づく変分オートエンコーダを用いて高次元低サンプルサイズ(HDLSS)設定でデータ拡張を行う新しい手法を提案する。
我々のアプローチは、リーマン多様体として見られるVAEの適切な潜在空間モデリングと、より有意義なサンプルを生成する新しい生成スキームを組み合わせる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.1529342790344802
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: In this paper, we propose a new method to perform data augmentation in a
reliable way in the High Dimensional Low Sample Size (HDLSS) setting using a
geometry-based variational autoencoder. Our approach combines a proper latent
space modeling of the VAE seen as a Riemannian manifold with a new generation
scheme which produces more meaningful samples especially in the context of
small data sets. The proposed method is tested through a wide experimental
study where its robustness to data sets, classifiers and training samples size
is stressed. It is also validated on a medical imaging classification task on
the challenging ADNI database where a small number of 3D brain MRIs are
considered and augmented using the proposed VAE framework. In each case, the
proposed method allows for a significant and reliable gain in the
classification metrics. For instance, balanced accuracy jumps from 66.3% to
74.3% for a state-of-the-art CNN classifier trained with 50 MRIs of cognitively
normal (CN) and 50 Alzheimer disease (AD) patients and from 77.7% to 86.3% when
trained with 243 CN and 210 AD while improving greatly sensitivity and
specificity metrics.
- Abstract(参考訳): 本稿では,幾何に基づく変分オートエンコーダを用いた高次元低サンプルサイズ(HDLSS)設定において,信頼性の高いデータ拡張を行う新しい手法を提案する。
我々のアプローチは、リーマン多様体として見られるVAEの適切な潜在空間モデリングと、特に小さなデータセットの文脈においてより有意義なサンプルを生成する新しい生成スキームを組み合わせる。
提案手法は, データセット, 分類器, トレーニングサンプルサイズに対するロバスト性を重視した広範囲な実験により検証された。
また,提案するvaeフレームワークを用いて,少数の3次元脳mriを検討・拡張したadniデータベース上での医用画像分類タスクについても検証した。
いずれの場合も,提案手法は分類基準において有意かつ確実な利得が得られる。
例えば、認知正常(CN)50MRIで訓練された最先端のCNN分類器の66.3%から74.3%、認知正常(CN)50例、アルツハイマー病(AD)患者77.7%から86.3%まで、そして243 CNと210 ADで訓練された場合、感度と特異度を大きく改善した。
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