論文の概要: Neural Entity Recognition with Gazetteer based Fusion
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.13225v1
- Date: Thu, 27 May 2021 15:14:15 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-28 16:40:28.964427
- Title: Neural Entity Recognition with Gazetteer based Fusion
- Title(参考訳): Gazetteer-based Fusion を用いたニューラルエンティティ認識
- Authors: Qing Sun, Parminder Bhatia
- Abstract要約: そこで我々は,NERシステムを用いて補助的なガゼテアモデルを提案し,その結果,異なる臨床データセット間での堅牢性と解釈性が向上することを示した。
我々のガゼッテラーベース核融合モデルは、データ効率が良く、20%のトレーニングデータを用いてi2b2データセット上で+1.7マイクロF1ゲインを達成することができ、トレーニング中に提示されなかった新しいエンティティの言及に4.7マイクロF1ゲインをもたらす。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.024494879945238
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Incorporating external knowledge into Named Entity Recognition (NER) systems
has been widely studied in the generic domain. In this paper, we focus on
clinical domain where only limited data is accessible and interpretability is
important. Recent advancement in technology and the acceleration of clinical
trials has resulted in the discovery of new drugs, procedures as well as
medical conditions. These factors motivate towards building robust zero-shot
NER systems which can quickly adapt to new medical terminology. We propose an
auxiliary gazetteer model and fuse it with an NER system, which results in
better robustness and interpretability across different clinical datasets. Our
gazetteer based fusion model is data efficient, achieving +1.7 micro-F1 gains
on the i2b2 dataset using 20% training data, and brings + 4.7 micro-F1 gains on
novel entity mentions never presented during training. Moreover, our fusion
model is able to quickly adapt to new mentions in gazetteers without
re-training and the gains from the proposed fusion model are transferable to
related datasets.
- Abstract(参考訳): 名前付きエンティティ認識(NER)システムに外部知識を組み込むことは、ジェネリックドメインにおいて広く研究されている。
本稿では,限られたデータしかアクセスできず,解釈性が重要である臨床領域に注目した。
近年の技術進歩と臨床試験の加速は、新しい薬物、処置、および医療条件の発見につながっている。
これらの要因は、新しい医学用語に迅速に適応できる堅牢なゼロショットナーシステムの構築に動機づけられている。
そこで我々は,NERシステムを用いて補助的なガゼテアモデルを提案し,その結果,異なる臨床データセット間での堅牢性と解釈性が向上することを示した。
我々のガゼッテラーベース核融合モデルはデータ効率が良く、20%のトレーニングデータを用いてi2b2データセット上で+1.7マイクロF1ゲインを達成する。
さらに,我々の融合モデルは,再学習することなく,ガゼッタにおける新たな言及に迅速に適応することができ,提案する融合モデルからのゲインは関連するデータセットに転送可能である。
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