論文の概要: A Novel Self-Learning Framework for Bladder Cancer Grading Using
Histopathological Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2106.13559v1
- Date: Fri, 25 Jun 2021 11:04:04 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-06-28 13:10:12.068379
- Title: A Novel Self-Learning Framework for Bladder Cancer Grading Using
Histopathological Images
- Title(参考訳): 病理組織像を用いた膀胱癌診断のための新しい自己学習フレームワーク
- Authors: Gabriel Garc\'ia, Anna Esteve, Adri\'an Colomer, David Ramos and
Valery Naranjo
- Abstract要約: 組織像から膀胱癌を診断するための自己学習の枠組みについて検討した。
組織学的パッチを病のさまざまなレベルに分類できる新しいDeep Convolutional Embedded Attention Clustering (DCEAC)を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.244681179922733
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Recently, bladder cancer has been significantly increased in terms of
incidence and mortality. Currently, two subtypes are known based on tumour
growth: non-muscle invasive (NMIBC) and muscle-invasive bladder cancer (MIBC).
In this work, we focus on the MIBC subtype because it is of the worst prognosis
and can spread to adjacent organs. We present a self-learning framework to
grade bladder cancer from histological images stained via immunohistochemical
techniques. Specifically, we propose a novel Deep Convolutional Embedded
Attention Clustering (DCEAC) which allows classifying histological patches into
different severity levels of the disease, according to the patterns established
in the literature. The proposed DCEAC model follows a two-step fully
unsupervised learning methodology to discern between non-tumour, mild and
infiltrative patterns from high-resolution samples of 512x512 pixels. Our
system outperforms previous clustering-based methods by including a
convolutional attention module, which allows refining the features of the
latent space before the classification stage. The proposed network exceeds
state-of-the-art approaches by 2-3% across different metrics, achieving a final
average accuracy of 0.9034 in a multi-class scenario. Furthermore, the reported
class activation maps evidence that our model is able to learn by itself the
same patterns that clinicians consider relevant, without incurring prior
annotation steps. This fact supposes a breakthrough in muscle-invasive bladder
cancer grading which bridges the gap with respect to train the model on
labelled data.
- Abstract(参考訳): 近年,膀胱癌の発生率と死亡率の増加がみられた。
現在、NMIBC(非筋浸潤性膀胱癌)とMIBC(筋浸潤性膀胱癌)の2つのサブタイプが知られている。
本研究では,mibcサブタイプに焦点をあてる。これは最悪の予後であり,隣接する臓器に拡がる可能性があるためである。
組織像を免疫組織化学的手法により染色した膀胱癌に対する自己学習フレームワークを提案する。
具体的には、本論文で確立されたパターンに従って、組織学的パッチを病の重症度に分類できる新しいDeep Convolutional Embedded Attention Clustering (DCEAC)を提案する。
提案したDCEACモデルは,512×512ピクセルの高分解能試料から非腫瘍,軽度,浸透パターンを識別する2段階の完全教師なし学習手法に従う。
本システムでは,従来のクラスタリング手法よりも,階層化前の潜伏空間の特徴を精査するコンボリューショナルアテンションモジュールを組み込むことで,性能を向上する。
提案されたネットワークは最先端のアプローチを異なるメトリクスで2-3%上回り、マルチクラスのシナリオでは 0.9034 という最終的な平均精度を達成している。
さらに、報告されたクラスアクティベーションマップは、我々のモデルが、事前のアノテーションステップを発生させることなく、臨床医が考慮するパターンと同じパターンで学習できることを示す。
この事実は、ラベル付きデータでモデルを訓練する際のギャップを埋める筋肉浸潤性膀胱がんのグレーディングにおけるブレークスルーである。
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