論文の概要: Transfer Learning in Electronic Health Records through Clinical Concept
Embedding
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2107.12919v1
- Date: Tue, 27 Jul 2021 16:22:02 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-07-28 18:12:31.877308
- Title: Transfer Learning in Electronic Health Records through Clinical Concept
Embedding
- Title(参考訳): 臨床概念埋め込みによる電子健康記録の伝達学習
- Authors: Jose Roberto Ayala Solares, Yajie Zhu, Abdelaali Hassaine, Shishir
Rao, Yikuan Li, Mohammad Mamouei, Dexter Canoy, Kazem Rahimi, Gholamreza
Salimi-Khorshidi
- Abstract要約: 我々は,3100万人の患者から得られた包括的EHRデータに基づいて,最も顕著な疾患埋め込み技術を訓練することを目指している。
本研究は,臨床概念埋込み評価のための総合的アプローチとしては初めてである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Deep learning models have shown tremendous potential in learning
representations, which are able to capture some key properties of the data.
This makes them great candidates for transfer learning: Exploiting
commonalities between different learning tasks to transfer knowledge from one
task to another. Electronic health records (EHR) research is one of the domains
that has witnessed a growing number of deep learning techniques employed for
learning clinically-meaningful representations of medical concepts (such as
diseases and medications). Despite this growth, the approaches to benchmark and
assess such learned representations (or, embeddings) is under-investigated;
this can be a big issue when such embeddings are shared to facilitate transfer
learning. In this study, we aim to (1) train some of the most prominent disease
embedding techniques on a comprehensive EHR data from 3.1 million patients, (2)
employ qualitative and quantitative evaluation techniques to assess these
embeddings, and (3) provide pre-trained disease embeddings for transfer
learning. This study can be the first comprehensive approach for clinical
concept embedding evaluation and can be applied to any embedding techniques and
for any EHR concept.
- Abstract(参考訳): ディープラーニングモデルは、データのいくつかの重要な特性をキャプチャできる学習表現において、大きな可能性を秘めています。
異なる学習タスク間の共通性を利用して、あるタスクから別のタスクに知識を転送するのです。
電子健康記録(EHR、Electronic Health Record)研究は、医療概念(疾患や医薬品など)の臨床的に意味のある表現を学習するために使われる多くの深層学習技術を目撃した分野の1つである。
この成長にもかかわらず、そのような学習された表現(あるいは埋め込み)をベンチマークして評価するアプローチは、過小評価されている。
本研究の目的は,(1)3100万人の患者から得られた包括的EHRデータに基づいて,最も顕著な疾患埋め込み技術をトレーニングすること,(2)これらの埋め込みを評価するために質的,定量的な評価手法を採用すること,(3)移行学習のための事前訓練された疾患埋め込みを提供することである。
本研究は臨床概念埋め込み評価のための最初の包括的アプローチであり,任意の埋め込み技術および任意のehr概念に適用できる。
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