論文の概要: An explainable two-dimensional single model deep learning approach for
Alzheimer's disease diagnosis and brain atrophy localization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2107.13200v1
- Date: Wed, 28 Jul 2021 07:19:00 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-07-29 14:04:40.925106
- Title: An explainable two-dimensional single model deep learning approach for
Alzheimer's disease diagnosis and brain atrophy localization
- Title(参考訳): アルツハイマー病診断と脳萎縮の鑑別のための2次元1次元深層学習法
- Authors: Fan Zhang, Bo Pan, Pengfei Shao, Peng Liu (Alzheimer's Disease
Neuroimaging Initiative, the Australian Imaging Biomarkers and Lifestyle
flagship study of ageing), Shuwei Shen, Peng Yao, Ronald X. Xu
- Abstract要約: 本稿では、アルツハイマー病(AD)の自動診断と、sMRIデータから、この疾患に関連する重要な脳領域の局所化について、エンドツーエンドのディープラーニングアプローチを提案する。
提案手法は,AD対認知正常(CN)とプログレッシブMCI(pMCI)と安定MCI(sMCI)の2つの分類タスクに対して,パブリックアクセス可能な2つのデータセットで評価されている。
実験結果から,本手法はマルチモデルや3次元CNN手法など,最先端の手法よりも優れていたことが示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.9281410693767036
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Early and accurate diagnosis of Alzheimer's disease (AD) and its prodromal
period mild cognitive impairment (MCI) is essential for the delayed disease
progression and the improved quality of patients'life. The emerging
computer-aided diagnostic methods that combine deep learning with structural
magnetic resonance imaging (sMRI) have achieved encouraging results, but some
of them are limit of issues such as data leakage and unexplainable diagnosis.
In this research, we propose a novel end-to-end deep learning approach for
automated diagnosis of AD and localization of important brain regions related
to the disease from sMRI data. This approach is based on a 2D single model
strategy and has the following differences from the current approaches: 1)
Convolutional Neural Network (CNN) models of different structures and
capacities are evaluated systemically and the most suitable model is adopted
for AD diagnosis; 2) a data augmentation strategy named Two-stage Random
RandAugment (TRRA) is proposed to alleviate the overfitting issue caused by
limited training data and to improve the classification performance in AD
diagnosis; 3) an explainable method of Grad-CAM++ is introduced to generate the
visually explainable heatmaps that localize and highlight the brain regions
that our model focuses on and to make our model more transparent. Our approach
has been evaluated on two publicly accessible datasets for two classification
tasks of AD vs. cognitively normal (CN) and progressive MCI (pMCI) vs. stable
MCI (sMCI). The experimental results indicate that our approach outperforms the
state-of-the-art approaches, including those using multi-model and 3D CNN
methods. The resultant localization heatmaps from our approach also highlight
the lateral ventricle and some disease-relevant regions of cortex, coincident
with the commonly affected regions during the development of AD.
- Abstract(参考訳): 遅発性疾患の進行と患者の生活の質向上には,早期かつ正確なアルツハイマー病(AD)とその前頭葉型軽度認知障害(MCI)が不可欠である。
深層学習と構造的磁気共鳴画像(sMRI)を組み合わせたコンピュータ支援診断法は,有望な結果を得たが,その一部はデータ漏洩や説明不能な診断などの問題に限られている。
本研究では,ADの自動診断とsMRIデータからの重要な脳領域の局在化のための,新しいエンドツーエンドディープラーニング手法を提案する。
This approach is based on a 2D single model strategy and has the following differences from the current approaches: 1) Convolutional Neural Network (CNN) models of different structures and capacities are evaluated systemically and the most suitable model is adopted for AD diagnosis; 2) a data augmentation strategy named Two-stage Random RandAugment (TRRA) is proposed to alleviate the overfitting issue caused by limited training data and to improve the classification performance in AD diagnosis; 3) an explainable method of Grad-CAM++ is introduced to generate the visually explainable heatmaps that localize and highlight the brain regions that our model focuses on and to make our model more transparent.
提案手法は,AD vs. 認知正常 (CN) とプログレッシブMCI (pMCI) と安定MCI (sMCI) の2つの分類タスクに対して,パブリックアクセス可能な2つのデータセットで評価されている。
実験の結果,マルチモデルと3d cnnを用いた手法を含め,最先端のアプローチよりも優れた手法が得られた。
このアプローチで得られた局所熱マップは、adの発達中に一般的に影響を受ける領域と一致し、側心室といくつかの疾患関連領域を強調する。
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