論文の概要: A Similarity Measure of Histopathology Images by Deep Embeddings
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2107.13703v1
- Date: Thu, 29 Jul 2021 01:45:33 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-07-30 13:11:59.865021
- Title: A Similarity Measure of Histopathology Images by Deep Embeddings
- Title(参考訳): 深層埋め込みによる病理組織像の類似度測定
- Authors: Mehdi Afshari, H.R. Tizhoosh
- Abstract要約: 本研究では,高解像度ギガピクセル病理像に対するコンテントベース類似度尺度を提案する。
提案された類似度尺度は、行列に類似したコサインベクトルの拡張である。
その結果, スライドラベルの類似度は最大93.18%であり, トップ5検索では5倍の精度で93.18%であることがわかった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Histopathology digital scans are large-size images that contain valuable
information at the pixel level. Content-based comparison of these images is a
challenging task. This study proposes a content-based similarity measure for
high-resolution gigapixel histopathology images. The proposed similarity
measure is an expansion of cosine vector similarity to a matrix. Each image is
divided into same-size patches with a meaningful amount of information (i.e.,
contained enough tissue). The similarity is measured by the extraction of
patch-level deep embeddings of the last pooling layer of a pre-trained deep
model at four different magnification levels, namely, 1x, 2.5x, 5x, and 10x
magnifications. In addition, for faster measurement, embedding reduction is
investigated. Finally, to assess the proposed method, an image search method is
implemented. Results show that the similarity measure represents the slide
labels with a maximum accuracy of 93.18\% for top-5 search at 5x magnification.
- Abstract(参考訳): 病理組織学 デジタルスキャンは、ピクセルレベルで貴重な情報を含む大きな画像である。
これらの画像のコンテンツベース比較は難しい課題である。
本研究では,高解像度ギガピクセル病理像に対するコンテントベース類似度尺度を提案する。
提案された類似度尺度は、行列に類似したコサインベクトルの拡張である。
各画像は、有意義な量の情報(つまり十分な組織を含む)を持つ同サイズのパッチに分割される。
この類似性は、4つの異なる倍率(1x, 2.5x, 5x, 10x)で事前訓練された深層モデルの最後のプール層のパッチレベルの深い埋め込みの抽出によって測定される。
さらに、より高速な測定のために、埋め込み削減について検討する。
最後に,提案手法を評価するため,画像検索手法を実装した。
その結果, スライドラベルの類似度は最大精度93.18\%であり, トップ5検索では5倍であることがわかった。
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