論文の概要: OncoNet: Weakly Supervised Siamese Network to automate cancer treatment
response assessment between longitudinal FDG PET/CT examinations
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2108.02016v1
- Date: Tue, 3 Aug 2021 17:48:05 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-08-05 13:13:00.284700
- Title: OncoNet: Weakly Supervised Siamese Network to automate cancer treatment
response assessment between longitudinal FDG PET/CT examinations
- Title(参考訳): onconet: weakly supervised siamese network による縦型fdg pet/ct検査における癌治療反応評価の自動化
- Authors: Anirudh Joshi, Sabri Eyuboglu, Shih-Cheng Huang, Jared Dunnmon, Arjun
Soin, Guido Davidzon, Akshay Chaudhari, Matthew P Lungren
- Abstract要約: OncoNetは1,954対の連続FDG PET/CT試験から処理応答を評価する新しい機械学習アルゴリズムである。
OncoNetは、スキャン間の変化を決定するために、それぞれ内部および外部の試験セットで0.86と0.84のAUROCを実証している。
我々は、医療研究コミュニティにおける幅広い機械学習に対する応答評価を目的とした、1,954組のFDG PET/CT試験のデータセットをキュレートした。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.3312092687309662
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: FDG PET/CT imaging is a resource intensive examination critical for managing
malignant disease and is particularly important for longitudinal assessment
during therapy. Approaches to automate longtudinal analysis present many
challenges including lack of available longitudinal datasets, managing complex
large multimodal imaging examinations, and need for detailed annotations for
traditional supervised machine learning. In this work we develop OncoNet, novel
machine learning algorithm that assesses treatment response from a 1,954 pairs
of sequential FDG PET/CT exams through weak supervision using the standard
uptake values (SUVmax) in associated radiology reports. OncoNet demonstrates an
AUROC of 0.86 and 0.84 on internal and external institution test sets
respectively for determination of change between scans while also showing
strong agreement to clinical scoring systems with a kappa score of 0.8. We also
curated a dataset of 1,954 paired FDG PET/CT exams designed for response
assessment for the broader machine learning in healthcare research community.
Automated assessment of radiographic response from FDG PET/CT with OncoNet
could provide clinicians with a valuable tool to rapidly and consistently
interpret change over time in longitudinal multi-modal imaging exams.
- Abstract(参考訳): FDG PET/CT画像検査は悪性疾患の診断に重要であり,特に治療中の縦断的評価において重要である。
長期分析を自動化するアプローチには、利用可能な縦型データセットの欠如、複雑な大規模マルチモーダル画像検査の管理、従来の教師あり機械学習のための詳細なアノテーションの必要性など、多くの課題がある。
本研究は,1,954対の連続FDG PET/CT検診の処理応答を,関連する放射線学報告における標準取り込み値(SUVmax)を用いて,弱い監視により評価する新しい機械学習アルゴリズムであるOncoNetを開発する。
OncoNetは、内部および外部の機関試験セットでそれぞれ0.86と0.84のAUROCを示し、スキャン間の変化を判定すると同時に、Kappaスコア0.8の臨床スコアシステムと強い一致を示した。
また,医療研究コミュニティの広範な機械学習に対する応答評価のために設計された1,954組のfdg pet/ct試験データセットを収集した。
OncoNetによるFDG PET/CTからのX線学的反応の自動評価は, 経時的マルチモーダル画像検査において, 経時的変化を迅速かつ一貫的に解釈する貴重なツールを提供する可能性がある。
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