論文の概要: Lung Ultrasound Segmentation and Adaptation between COVID-19 and
Community-Acquired Pneumonia
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2108.03138v1
- Date: Fri, 6 Aug 2021 14:17:51 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-08-09 16:28:30.833252
- Title: Lung Ultrasound Segmentation and Adaptation between COVID-19 and
Community-Acquired Pneumonia
- Title(参考訳): 肺超音波の分節化とcovid-19と市中肺炎の適応
- Authors: Harry Mason, Lorenzo Cristoni, Andrew Walden, Roberto Lazzari, Thomas
Pulimood, Louis Grandjean, Claudia AM Gandini Wheeler-Kingshott, Yipeng Hu,
Zachary MC Baum
- Abstract要約: 深層ニューラルネットワークを用いた超音声的B線分割作業に着目する。
我々は、COVID-19とCAP肺超音波データの両方を用いて、ネットワークをトレーニングする。
いずれかのタイプの肺疾患を推測する際には、様々な臨床応用が期待できる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.17159130619349347
- License: http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
- Abstract: Lung ultrasound imaging has been shown effective in detecting typical
patterns for interstitial pneumonia, as a point-of-care tool for both patients
with COVID-19 and other community-acquired pneumonia (CAP). In this work, we
focus on the hyperechoic B-line segmentation task. Using deep neural networks,
we automatically outline the regions that are indicative of pathology-sensitive
artifacts and their associated sonographic patterns. With a real-world
data-scarce scenario, we investigate approaches to utilize both COVID-19 and
CAP lung ultrasound data to train the networks; comparing fine-tuning and
unsupervised domain adaptation. Segmenting either type of lung condition at
inference may support a range of clinical applications during evolving epidemic
stages, but also demonstrates value in resource-constrained clinical scenarios.
Adapting real clinical data acquired from COVID-19 patients to those from CAP
patients significantly improved Dice scores from 0.60 to 0.87 (p < 0.001) and
from 0.43 to 0.71 (p < 0.001), on independent COVID-19 and CAP test cases,
respectively. It is of practical value that the improvement was demonstrated
with only a small amount of data in both training and adaptation data sets, a
common constraint for deploying machine learning models in clinical practice.
Interestingly, we also report that the inverse adaptation, from labelled CAP
data to unlabeled COVID-19 data, did not demonstrate an improvement when tested
on either condition. Furthermore, we offer a possible explanation that
correlates the segmentation performance to label consistency and data domain
diversity in this point-of-care lung ultrasound application.
- Abstract(参考訳): 肺超音波検査は間質性肺炎の典型的なパターンを検出するのに有効であることが、COVID-19および他の地域性肺炎(CAP)患者のポイント・オブ・ケア・ツールとして示されている。
本研究では,ハイパーエコーb線分節化タスクに注目する。
深層ニューラルネットワークを用いて病理に敏感なアーチファクトとその超音波パターンを示す領域を自動的に概説する。
実世界のデータスカースシナリオでは、COVID-19とCAP肺超音波データを用いてネットワークをトレーニングする手法について検討し、微調整と教師なしドメイン適応の比較を行った。
いずれのタイプの肺条件を推論において分割することは、流行の進行段階において様々な臨床応用をサポートするが、資源制約された臨床シナリオの価値も示す。
実際の臨床データをCAP患者に適応させることで、Diceのスコアは0.60から0.87(p < 0.001)に、独立したCOVID-19患者では0.43から0.71(p < 0.001)に改善した。
臨床実践において機械学習モデルをデプロイするための一般的な制約であるトレーニングデータセットと適応データセットの両方において、少量のデータだけで改善が実証されたことは実用的価値である。
また,ラベル付きCAPデータから未ラベルのCOVID-19データへの逆適応は,いずれの条件においても改善しなかったことも報告した。
さらに, このポイント・オブ・ケア肺超音波応用において, セグメンテーション性能とラベルの一貫性, データ領域の多様性を相関させる可能性を示す。
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