論文の概要: Automatic Preprocessing and Ensemble Learning for Low Quality Cell Image
Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2108.13118v1
- Date: Mon, 30 Aug 2021 10:58:20 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-08-31 14:25:44.856224
- Title: Automatic Preprocessing and Ensemble Learning for Low Quality Cell Image
Segmentation
- Title(参考訳): 低品質セル画像分割のための自動前処理とアンサンブル学習
- Authors: Sota Kato, Kazuhiro Hotta
- Abstract要約: 深層学習により認識し易い画像に入力画像を変換する手法を提案する。
低品質の入力セル画像は、第1のネットワークにおける特徴マップによって変換され、翻訳された画像は、セマンティックセグメンテーションのために第2のネットワークに入力される。
2つのネットワークはエンドツーエンドで訓練されており、翻訳のために高品質な画像を作成する必要はない。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 10.305130700118399
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We propose an automatic preprocessing and ensemble learning for segmentation
of cell images with low quality. It is difficult to capture cells with strong
light. Therefore, the microscopic images of cells tend to have low image
quality but these images are not good for semantic segmentation. Here we
propose a method to translate an input image to the images that are easy to
recognize by deep learning. The proposed method consists of two deep neural
networks. The first network is the usual training for semantic segmentation,
and penultimate feature maps of the first network are used as filters to
translate an input image to the images that emphasize each class. This is the
automatic preprocessing and translated cell images are easily classified. The
input cell image with low quality is translated by the feature maps in the
first network, and the translated images are fed into the second network for
semantic segmentation. Since the outputs of the second network are multiple
segmentation results, we conduct the weighted ensemble of those segmentation
images. Two networks are trained by end-to-end manner, and we do not need to
prepare images with high quality for the translation. We confirmed that our
proposed method can translate cell images with low quality to the images that
are easy to segment, and segmentation accuracy has improved using the weighted
ensemble learning.
- Abstract(参考訳): 高品質なセル画像のセグメンテーションのための自動前処理とアンサンブル学習を提案する。
強い光で細胞を捕獲することは困難である。
したがって、細胞の顕微鏡画像は画質が低い傾向にあるが、これらの画像はセマンティックセグメンテーションには向いていない。
本稿では,深層学習によって認識しやすい画像に入力画像を変換する手法を提案する。
提案手法は2つの深層ニューラルネットワークからなる。
第1のネットワークはセマンティックセグメンテーションのための通常のトレーニングであり、第1のネットワークの特徴マップをフィルタとして使用して、各クラスを強調する画像に入力画像を変換する。
これは自動前処理であり、翻訳された細胞画像は容易に分類できる。
低品質の入力セル画像を第1のネットワークの特徴地図で翻訳し、その変換画像を第2のネットワークに供給して意味セグメンテーションを行う。
第2のネットワークの出力は複数のセグメンテーション結果であるため、これらのセグメンテーション画像の重み付けアンサンブルを行う。
2つのネットワークはエンドツーエンドでトレーニングされており、翻訳に高品質な画像を作成する必要はない。
提案手法では,低画質のセルイメージを分割し易い画像に変換できることを確認し,重み付きアンサンブル学習によりセグメント化精度が向上した。
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