論文の概要: Global-Local Transformer for Brain Age Estimation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2109.01663v1
- Date: Fri, 3 Sep 2021 01:39:58 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-09-19 13:44:04.001756
- Title: Global-Local Transformer for Brain Age Estimation
- Title(参考訳): 脳年齢推定のためのグローバルローカルトランス
- Authors: Sheng He, P. Ellen Grant, Yangming Ou
- Abstract要約: 深層学習は脳磁気共鳴画像(MRI)に基づく迅速な脳年齢推定を可能にする
ほとんどの研究では、局所的なきめ細かい詳細を無視して、入力画像全体からグローバル情報を抽出するために1つのニューラルネットワークを使用している。
入力画像全体からグローバルコンテキスト情報を抽出するグローバルパスと、ローカルパッチから局所的な微細な詳細情報を抽出するローカルパスとからなるグローバルローカルトランスフォーマーを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.222802562733787
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Deep learning can provide rapid brain age estimation based on brain magnetic
resonance imaging (MRI). However, most studies use one neural network to
extract the global information from the whole input image, ignoring the local
fine-grained details. In this paper, we propose a global-local transformer,
which consists of a global-pathway to extract the global-context information
from the whole input image and a local-pathway to extract the local
fine-grained details from local patches. The fine-grained information from the
local patches are fused with the global-context information by the attention
mechanism, inspired by the transformer, to estimate the brain age. We evaluate
the proposed method on 8 public datasets with 8,379 healthy brain MRIs with the
age range of 0-97 years. 6 datasets are used for cross-validation and 2
datasets are used for evaluating the generality. Comparing with other
state-of-the-art methods, the proposed global-local transformer reduces the
mean absolute error of the estimated ages to 2.70 years and increases the
correlation coefficient of the estimated age and the chronological age to
0.9853. In addition, our proposed method provides regional information of which
local patches are most informative for brain age estimation. Our source code is
available on: \url{https://github.com/shengfly/global-local-transformer}.
- Abstract(参考訳): 深層学習は、脳磁気共鳴画像(MRI)に基づく迅速な脳年齢推定を提供する。
しかし、ほとんどの研究は1つのニューラルネットワークを使用して入力画像全体からグローバル情報を抽出し、局所的な細部の詳細を無視している。
本稿では,全入力画像からグローバルコンテキスト情報を抽出するグローバルパスと,ローカルパッチから局所的な微細な詳細情報を抽出するローカルパスとからなるグローバルローカルトランスフォーマーを提案する。
局所パッチからのきめ細かい情報は、脳年齢を推定するために、トランスフォーマーにインスパイアされた注意機構によってグローバルコンテキスト情報と融合される。
0~97歳以下の健常脳MRI8,379例を対象に,提案手法の評価を行った。
クロスバリデーションには6つのデータセット,一般性評価には2つのデータセットが使用されている。
他の最先端の方法と比較して、提案手法は推定年齢の平均絶対誤差を2.70歳に減らし、推定年齢と時系列年齢の相関係数を0.9853に引き上げる。
また,提案手法は,脳年齢推定において局所パッチが最も有用な地域情報を提供する。
ソースコードは \url{https://github.com/shengfly/global-local-transformer} で利用可能です。
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