論文の概要: Estimating Brain Age with Global and Local Dependencies
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2209.08933v1
- Date: Mon, 19 Sep 2022 11:30:18 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-20 19:50:45.655953
- Title: Estimating Brain Age with Global and Local Dependencies
- Title(参考訳): グローバル・ローカル・インダクタンスによる脳年齢推定
- Authors: Yanwu Yang, Xutao Guo, Zhikai Chang, Chenfei Ye, Yang Xiang, Haiyan
Lv, Ting Ma
- Abstract要約: グローバルおよびローカルな依存関係を解釈する脳年齢を学習するための新しいネットワークを提案する。
我々のネットワークは一連の深層学習手法の中で最も優れており、検証セットの平均絶対誤差(MAE)は2.855で、独立したテストセットでは2.911であった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.182477614847903
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The brain age has been proven to be a phenotype of relevance to cognitive
performance and brain disease. Achieving accurate brain age prediction is an
essential prerequisite for optimizing the predicted brain-age difference as a
biomarker. As a comprehensive biological characteristic, the brain age is hard
to be exploited accurately with models using feature engineering and local
processing such as local convolution and recurrent operations that process one
local neighborhood at a time. Instead, Vision Transformers learn global
attentive interaction of patch tokens, introducing less inductive bias and
modeling long-range dependencies. In terms of this, we proposed a novel network
for learning brain age interpreting with global and local dependencies, where
the corresponding representations are captured by Successive Permuted
Transformer (SPT) and convolution blocks. The SPT brings computation efficiency
and locates the 3D spatial information indirectly via continuously encoding 2D
slices from different views. Finally, we collect a large cohort of 22645
subjects with ages ranging from 14 to 97 and our network performed the best
among a series of deep learning methods, yielding a mean absolute error (MAE)
of 2.855 in validation set, and 2.911 in an independent test set.
- Abstract(参考訳): 脳年齢は認知能力と脳疾患に関連する表現型であることが証明されている。
正確な脳年齢予測を達成することは、予測された脳年齢差をバイオマーカーとして最適化するための必須条件である。
包括的生物学的特徴として、特徴工学と局所的畳み込みや局所的局所的操作などの局所的処理を用いたモデルを用いて、脳年齢を正確に評価することは困難である。
代わりにVision Transformersはパッチトークンのグローバルな注意的相互作用を学び、誘導バイアスを減らし、長距離依存関係をモデル化する。
そこで本研究では,大域的および局所的な依存関係を持つ脳年齢を学習するための新しいネットワークを提案し,それに対応する表現を逐次置換トランスフォーマ(spt)と畳み込みブロックでキャプチャする。
SPTは計算効率をもたらし、異なるビューから連続的に2Dスライスを符号化することで、3D空間情報を間接的に位置付けする。
最後に,14歳から97歳までの22645名の被験者の大規模なコホートを収集し,ネットワークが一連の深層学習手法の中で最善を尽くし,平均絶対誤差(MAE)が2.855人,独立テストセットが2.911人となった。
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