論文の概要: Self-supervised Tumor Segmentation through Layer Decomposition
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2109.03230v1
- Date: Tue, 7 Sep 2021 17:58:35 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-09-08 14:34:30.210955
- Title: Self-supervised Tumor Segmentation through Layer Decomposition
- Title(参考訳): 層分解を介する自己教師付き腫瘍分画
- Authors: Xiaoman Zhang, Weidi Xie, Chaoqin Huang, Ya Zhang, and Yanfeng Wang
- Abstract要約: 腫瘍の分節に対する自己監督的アプローチを提案する。
具体的には、下流タスクに自己教師付き学習モデルを直接適用すべきゼロショット設定を提唱する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 31.89022187980646
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: In this paper, we propose a self-supervised approach for tumor segmentation.
Specifically, we advocate a zero-shot setting, where models from
self-supervised learning should be directly applicable for the downstream task,
without using any manual annotations whatsoever. We make the following
contributions. First, with careful examination on existing self-supervised
learning approaches, we reveal the surprising result that, given suitable data
augmentation, models trained from scratch in fact achieve comparable
performance to those pre-trained with self-supervised learning. Second,
inspired by the fact that tumors tend to be characterized independently to the
contexts, we propose a scalable pipeline for generating synthetic tumor data,
and train a self-supervised model that minimises the generalisation gap with
the downstream task. Third, we conduct extensive ablation studies on different
downstream datasets, BraTS2018 for brain tumor segmentation and LiTS2017 for
liver tumor segmentation. While evaluating the model transferability for tumor
segmentation under a low-annotation regime, including an extreme case of
zero-shot segmentation, the proposed approach demonstrates state-of-the-art
performance, substantially outperforming all existing self-supervised
approaches, and opening up the usage of self-supervised learning in practical
scenarios.
- Abstract(参考訳): 本稿では,腫瘍のセグメンテーションに対する自己監督的アプローチを提案する。
具体的には,手動アノテーションをまったく使わずに,自己教師付き学習のモデルを下流タスクに直接適用するゼロショット設定を提唱する。
私たちは以下の貢献をします。
まず,既存の自己教師付き学習手法を慎重に検討した結果,適切なデータ拡張を前提として,スクラッチから学習したモデルが,自己教師付き学習で事前学習したモデルと同等の性能を達成できることが判明した。
第2に,腫瘍は文脈と独立して特徴付けられる傾向にあるという事実に着想を得て,合成腫瘍データを生成するスケーラブルなパイプラインを提案し,下流タスクとの一般化ギャップを最小化する自己教師付きモデルを訓練する。
第3に,脳腫瘍分画用brats2018,肝腫瘍分画用lits2017など,下流別データセットの広範なアブレーション研究を行った。
ゼロショットセグメンテーションの極端な事例を含む低アノテーション体制下での腫瘍セグメンテーションのモデル伝達性を評価する一方で、提案手法は最先端の性能を示し、既存の自己教師型アプローチを実質的に上回り、実践シナリオにおける自己教師型学習の使用を開放する。
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