Fugu-MT 論文翻訳(概要): Self-supervised driven consistency training for annotation efficient histopathology image analysis

論文の概要: Self-supervised driven consistency training for annotation efficient histopathology image analysis

arxiv url: http://arxiv.org/abs/2102.03897v2
Date: Tue, 9 Feb 2021 23:26:44 GMT
ステータス: 処理完了
システム内更新日: 2021-02-11 12:12:13.206726
Title: Self-supervised driven consistency training for annotation efficient histopathology image analysis
Title（参考訳）: アノテーション効率の高い組織病理画像解析のための自己監督駆動整合性訓練
Authors: Chetan L. Srinidhi, Seung Wook Kim, Fu-Der Chen, Anne L. Martel
Abstract要約: 大きなラベル付きデータセットでニューラルネットワークをトレーニングすることは、計算病理学において依然として支配的なパラダイムである。本研究では,非教師付き表現学習のための強力な監視信号を学ぶために,ヒストロジ全体スライディング画像の背景となる多段階的文脈的手がかりを利用する自己教師付きプレテキストタスクを提案する。また,タスク固有の未ラベルデータとの予測整合性に基づいて,事前学習した表現を下流タスクに効果的に転送することを学ぶ教師による半教師付き一貫性パラダイムを提案する。
参考スコア（独自算出の注目度）: 13.005873872821066
License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
Abstract: Training a neural network with a large labeled dataset is still a dominant paradigm in computational histopathology. However, obtaining such exhaustive manual annotations is often expensive, laborious, and prone to inter and Intra-observer variability. While recent self-supervised and semi-supervised methods can alleviate this need by learn-ing unsupervised feature representations, they still struggle to generalize well to downstream tasks when the number of labeled instances is small. In this work, we overcome this challenge by leveraging both task-agnostic and task-specific unlabeled data based on two novel strategies: i) a self-supervised pretext task that harnesses the underlying multi-resolution contextual cues in histology whole-slide images to learn a powerful supervisory signal for unsupervised representation learning; ii) a new teacher-student semi-supervised consistency paradigm that learns to effectively transfer the pretrained representations to downstream tasks based on prediction consistency with the task-specific un-labeled data. We carry out extensive validation experiments on three histopathology benchmark datasets across two classification and one regression-based tasks, i.e., tumor metastasis detection, tissue type classification, and tumor cellularity quantification. Under limited-label data, the proposed method yields tangible improvements, which is close or even outperforming other state-of-the-art self-supervised and supervised baselines. Furthermore, we empirically show that the idea of bootstrapping the self-supervised pretrained features is an effective way to improve the task-specific semi-supervised learning on standard benchmarks. Code and pretrained models will be made available at: https://github.com/srinidhiPY/SSL_CR_Histo
Abstract（参考訳）: 大きなラベル付きデータセットでニューラルネットワークをトレーニングすることは、計算病理学において依然として支配的なパラダイムである。しかし、このような徹底的な手動アノテーションの取得は、しばしば高価で手間がかかり、サーバ間およびオブジェクト間の変動が起こりやすい。最近の自己監視および半監視メソッドは、教師なしの機能表現を学習することによってこのニーズを軽減することができますが、ラベル付きインスタンスの数が少ない場合、ダウンストリームタスクにうまく一般化することは依然として困難です。 In this work, we overcome this challenge by leveraging both task-agnostic and task-specific unlabeled data based on two novel strategies: i) a self-supervised pretext task that harnesses the underlying multi-resolution contextual cues in histology whole-slide images to learn a powerful supervisory signal for unsupervised representation learning; ii) a new teacher-student semi-supervised consistency paradigm that learns to effectively transfer the pretrained representations to downstream tasks based on prediction consistency with the task-specific un-labeled data. 2つの分類と1つの回帰ベースのタスク、すなわち腫瘍転移検出、組織型分類、および腫瘍細胞性定量に関する3つの組織病理学的ベンチマークデータセットに関する広範な検証実験を実施します。限られたラベルデータに基づいて、提案手法は、他の最先端の自己監督および監督ベースラインに近づいたり、さらに性能を上回ったりする有形改善をもたらす。さらに、自己教師付き事前学習機能のブートストラップは、標準ベンチマークにおけるタスク固有の半教師付き学習を改善する効果的な方法であることを示す。コードとプリトレーニングされたモデルはhttps://github.com/srinidhiPY/SSL_CR_Histoで入手できる。

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