論文の概要: DSNet: A Dual-Stream Framework for Weakly-Supervised Gigapixel Pathology
Image Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2109.05788v1
- Date: Mon, 13 Sep 2021 09:10:43 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-09-14 15:34:41.405008
- Title: DSNet: A Dual-Stream Framework for Weakly-Supervised Gigapixel Pathology
Image Analysis
- Title(参考訳): DSNet: 弱スーパービジョンギガピクセル画像解析のためのデュアルストリームフレームワーク
- Authors: Tiange Xiang, Yang Song, Chaoyi Zhang, Dongnan Liu, Mei Chen, Fan
Zhang, Heng Huang, Lauren O'Donnell, Weidong Cai
- Abstract要約: スライド画像全体(WSI)を分類するための弱教師付きフレームワークを提案する。
WSIは通常、パッチレベルのラベルを持つパッチワイド分類によって処理される。
イメージレベルのラベルのみの場合、パッチの外観とイメージレベルのラベルの矛盾のため、パッチの分類はサブ最適となる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 78.78181964748144
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We present a novel weakly-supervised framework for classifying whole slide
images (WSIs). WSIs, due to their gigapixel resolution, are commonly processed
by patch-wise classification with patch-level labels. However, patch-level
labels require precise annotations, which is expensive and usually unavailable
on clinical data. With image-level labels only, patch-wise classification would
be sub-optimal due to inconsistency between the patch appearance and
image-level label. To address this issue, we posit that WSI analysis can be
effectively conducted by integrating information at both high magnification
(local) and low magnification (regional) levels. We auto-encode the visual
signals in each patch into a latent embedding vector representing local
information, and down-sample the raw WSI to hardware-acceptable thumbnails
representing regional information. The WSI label is then predicted with a
Dual-Stream Network (DSNet), which takes the transformed local patch embeddings
and multi-scale thumbnail images as inputs and can be trained by the
image-level label only. Experiments conducted on two large-scale public
datasets demonstrate that our method outperforms all recent state-of-the-art
weakly-supervised WSI classification methods.
- Abstract(参考訳): 本稿では,スライド画像全体(WSI)を分類する手法を提案する。
WSIは、ギガピクセルの解像度のため、一般にパッチレベルのラベルを持つパッチワイド分類によって処理される。
しかし、パッチレベルのラベルには正確なアノテーションが必要であり、これは高価であり、通常臨床データでは利用できない。
イメージレベルのラベルのみの場合、パッチの外観とイメージレベルのラベルの矛盾のため、パッチの分類はサブ最適となる。
この問題に対処するために,高倍率(局所)と低倍率(地域)の両方の情報を統合することで,wsi分析を効果的に行えることを実証する。
我々は各パッチの視覚信号をローカル情報を表す潜伏埋め込みベクトルに自動エンコードし、生のWSIをローカル情報を表すハードウェア対応サムネイルにダウンサンプリングする。
次に、wsiラベルは、変換されたローカルパッチ埋め込みとマルチスケールサムネイルイメージを入力として、イメージレベルラベルのみによってトレーニング可能なデュアルストリームネットワーク(dsnet)によって予測される。
2つの大規模公開データセットで行った実験は、我々の手法が最新の最先端のWSI分類方法よりも優れていることを示した。
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