論文の概要: Automated Multi-Process CTC Detection using Deep Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2109.12709v1
- Date: Sun, 26 Sep 2021 21:56:34 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-09-29 08:33:15.742342
- Title: Automated Multi-Process CTC Detection using Deep Learning
- Title(参考訳): 深層学習を用いた多工程CTC自動検出
- Authors: Elena Ivanova, Kam W. Leong, and Andrew F. Laine
- Abstract要約: 循環腫瘍細胞の自動同定のための新しい3段階検出モデルを提案する。
トレーニングデータセットは46の高分散データポイントと10の負と36の正のデータポイントで構成されている。
テストセットは420個の負のデータポイントで構成され、パイプラインの最終精度は98.81%である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.280824586913772
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Circulating Tumor Cells (CTCs) bear great promise as biomarkers in tumor
prognosis. However, the process of identification and later enumeration of CTCs
require manual labor, which is error-prone and time-consuming. The recent
developments in object detection via Deep Learning using Mask-RCNNs and wider
availability of pre-trained models have enabled sensitive tasks with limited
data of such to be tackled with unprecedented accuracy. In this report, we
present a novel 3-stage detection model for automated identification of
Circulating Tumor Cells in multi-channel darkfield microscopic images comprised
of: RetinaNet based identification of Cytokeratin (CK) stains, Mask-RCNN based
cell detection of DAPI cell nuclei and Otsu thresholding to detect CD-45s. The
training dataset is composed of 46 high variance data points, with 10 Negative
and 36 Positive data points. The test set is composed of 420 negative data
points. The final accuracy of the pipeline is 98.81%.
- Abstract(参考訳): 循環性腫瘍細胞 (CTC) は腫瘍予後におけるバイオマーカーとして有望である。
しかしながら、ctcの識別とその後の列挙のプロセスには手動作業が必要であり、これはエラーを起こしやすく、時間がかかる。
Mask-RCNNを用いたDeep Learningによるオブジェクト検出の最近の発展と、事前訓練されたモデルのより広範な利用により、制限されたデータによるセンシティブなタスクを前例のない精度で処理できるようになった。
本稿では,細胞ケラチン(ck)染色の網膜型同定,dapi細胞核のマスクrcnn型細胞検出,cd-45sの検出などを含む多チャンネル暗視野顕微鏡画像における循環性腫瘍細胞の自動同定のための3段階検出モデルを提案する。
トレーニングデータセットは46の高分散データポイントと10の負と36の正のデータポイントで構成されている。
テストセットは420の負のデータポイントからなる。
パイプラインの最終精度は98.81%である。
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