論文の概要: Super-resolution reconstruction of cytoskeleton image based on A-net
deep learning network
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2112.09574v1
- Date: Fri, 17 Dec 2021 15:33:47 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-12-20 19:03:44.577637
- Title: Super-resolution reconstruction of cytoskeleton image based on A-net
deep learning network
- Title(参考訳): A-net深層学習ネットワークを用いた細胞骨格画像の超解像再構成
- Authors: Qian Chen, Haoxin Bai, Bingchen Che, Tianyun Zhao, Ce Zhang, Kaige
Wang, Jintao Bai, Wei Zhao
- Abstract要約: 我々はA-netネットワークを提案し,分解モデルに基づくA-netディープラーニングネットワークとDWDCアルゴリズムを組み合わせることにより,サイトスケルトン画像の分解能を大幅に向上できることを示した。
生画像中の細胞構造を阻害するノイズや凝集構造を除去し,比較的小さなデータセットを用いて空間分解能を10倍改善した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.967593061012609
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: To date, live-cell imaging at the nanometer scale remains challenging. Even
though super-resolution microscopy methods have enabled visualization of
subcellular structures below the optical resolution limit, the spatial
resolution is still far from enough for the structural reconstruction of
biomolecules in vivo (i.e. ~24 nm thickness of microtubule fiber). In this
study, we proposed an A-net network and showed that the resolution of
cytoskeleton images captured by a confocal microscope can be significantly
improved by combining the A-net deep learning network with the DWDC algorithm
based on degradation model. Utilizing the DWDC algorithm to construct new
datasets and taking advantage of A-net neural network's features (i.e.,
considerably fewer layers), we successfully removed the noise and flocculent
structures, which originally interfere with the cellular structure in the raw
image, and improved the spatial resolution by 10 times using relatively small
dataset. We, therefore, conclude that the proposed algorithm that combines
A-net neural network with the DWDC method is a suitable and universal approach
for exacting structural details of biomolecules, cells and organs from
low-resolution images.
- Abstract(参考訳): 現在まで、ナノメートルスケールでのライブセルイメージングは困難である。
超高分解能顕微鏡法は光学分解能限界以下の細胞内構造の可視化を可能にしているが、空間分解能は生体内での生体分子の構造再構成(すなわち微小管繊維の24nmの厚さ)には程遠い。
本研究では,共焦点顕微鏡で撮影された細胞骨格画像の解像度を,分解モデルに基づくa-net深層学習ネットワークとdwdcアルゴリズムを組み合わせることで大幅に向上できることを示す。
DWDCアルゴリズムを用いて新しいデータセットを構築し、A-netニューラルネットワークの特徴(層がかなり少ない)を活用することで、生画像の細胞構造に干渉するノイズや凝集構造を除去し、比較的小さなデータセットを用いて空間分解能を10倍改善した。
したがって, a-netニューラルネットワークとdwdc法を組み合わせたアルゴリズムは, 低解像度画像から生体分子, 細胞, 臓器の構造的詳細を同定する上で, 適切かつ普遍的なアプローチであると考えられる。
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