論文の概要: Rxn Hypergraph: a Hypergraph Attention Model for Chemical Reaction Representation

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2201.01196v1
• Date: Sun, 2 Jan 2022 12:33:10 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2022-01-05 23:09:54.143555
• Title: Rxn Hypergraph: a Hypergraph Attention Model for Chemical Reaction Representation
• Title（参考訳）: Rxn Hypergraph:化学反応表現のためのハイパーグラフ注意モデル
• Authors: Mohammadamin Tavakoli, Alexander Shmakov, Francesco Ceccarelli, Pierre Baldi
• Abstract要約: 現在、化学反応を強固に表現するための普遍的で広く採用されている方法は存在しない。 ここでは、グラフに基づく分子構造の表現を利用して、ハイパーグラフアテンションニューラルネットワークアプローチを開発し、テストする。 我々はこのハイパーグラフ表現を3つの独立な化学反応データセットを用いて3つの実験で評価した。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 70.97737157902947
• License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
• Abstract: It is fundamental for science and technology to be able to predict chemical reactions and their properties. To achieve such skills, it is important to develop good representations of chemical reactions, or good deep learning architectures that can learn such representations automatically from the data. There is currently no universal and widely adopted method for robustly representing chemical reactions. Most existing methods suffer from one or more drawbacks, such as: (1) lacking universality; (2) lacking robustness; (3) lacking interpretability; or (4) requiring excessive manual pre-processing. Here we exploit graph-based representations of molecular structures to develop and test a hypergraph attention neural network approach to solve at once the reaction representation and property-prediction problems, alleviating the aforementioned drawbacks. We evaluate this hypergraph representation in three experiments using three independent data sets of chemical reactions. In all experiments, the hypergraph-based approach matches or outperforms other representations and their corresponding models of chemical reactions while yielding interpretable multi-level representations.
• Abstract（参考訳）: 科学と技術が化学反応とその特性を予測できることは基本的なことである。 このようなスキルを達成するためには、化学反応の優れた表現や、データからその表現を自動的に学習できる優れたディープラーニングアーキテクチャを開発することが重要である。 現在、化学反応を強固に表現するための普遍的で広く採用されている方法は存在しない。 既存のほとんどの手法は、(1)普遍性の欠如、(2)堅牢性の欠如、(3)解釈可能性の欠如、(4)過剰な手作業による事前処理などの欠点に悩まされている。 ここでは,分子構造のグラフベース表現を利用してハイパーグラフアテンションニューラルネットワークアプローチを開発し,反応表現と特性予測問題を一度に解くことで,上記の欠点を緩和する。 我々はこのハイパーグラフ表現を3つの独立な化学反応データセットを用いて3つの実験で評価した。 すべての実験において、ハイパーグラフに基づくアプローチは他の表現とそれに対応する化学反応のモデルに適合し、解釈可能な多レベル表現をもたらす。

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