論文の概要: Effect of Prior-based Losses on Segmentation Performance: A Benchmark
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2201.02428v3
- Date: Tue, 11 Jan 2022 15:31:37 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-01-13 00:05:16.220823
- Title: Effect of Prior-based Losses on Segmentation Performance: A Benchmark
- Title(参考訳): セグメンテーション性能に対する事前ベース損失の影響:ベンチマーク
- Authors: Rosana El Jurdi, Caroline Petitjean, Veronika Cheplygina, Paul
Honeine, Fahed Abdallah
- Abstract要約: 深層畳み込みニューラルネットワーク(CNN)は、医用画像セグメンテーションの最先端のパフォーマンスを実証している。
近年の研究では、物体の形状や境界といった事前の知識を損失関数の制約として取り入れることに焦点が当てられている。
本稿では,最近の医用画像のセグメンテーションにおける先行的損失のベンチマークを確立する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.6857153840014165
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Today, deep convolutional neural networks (CNNs) have demonstrated
state-of-the-art performance for medical image segmentation, on various imaging
modalities and tasks. Despite early success, segmentation networks may still
generate anatomically aberrant segmentations, with holes or inaccuracies near
the object boundaries. To enforce anatomical plausibility, recent research
studies have focused on incorporating prior knowledge such as object shape or
boundary, as constraints in the loss function. Prior integrated could be
low-level referring to reformulated representations extracted from the
ground-truth segmentations, or high-level representing external medical
information such as the organ's shape or size. Over the past few years,
prior-based losses exhibited a rising interest in the research field since they
allow integration of expert knowledge while still being architecture-agnostic.
However, given the diversity of prior-based losses on different medical imaging
challenges and tasks, it has become hard to identify what loss works best for
which dataset. In this paper, we establish a benchmark of recent prior-based
losses for medical image segmentation. The main objective is to provide
intuition onto which losses to choose given a particular task or dataset. To
this end, four low-level and high-level prior-based losses are selected. The
considered losses are validated on 8 different datasets from a variety of
medical image segmentation challenges including the Decathlon, the ISLES and
the WMH challenge. Results show that whereas low-level prior-based losses can
guarantee an increase in performance over the Dice loss baseline regardless of
the dataset characteristics, high-level prior-based losses can increase
anatomical plausibility as per data characteristics.
- Abstract(参考訳): 今日、深層畳み込みニューラルネットワーク(cnns)は、様々な画像モードやタスクに基づいて、医用画像セグメンテーションの最先端のパフォーマンスを実証している。
初期の成功にもかかわらず、セグメンテーションネットワークは依然として解剖学的に異常なセグメンテーションを生成し、オブジェクト境界付近に穴や不正確さがある。
解剖学的可能性を強化するために、近年の研究は、損失関数の制約として、物体形状や境界などの事前知識を取り入れることに焦点を当てている。
以前の統合は、基幹領域から抽出された再構成された表現を低レベル、または臓器の形状や大きさなどの外部医療情報を高レベルに表すことができる。
過去数年間、事前の損失は、アーキテクチャに依存しながら専門家の知識の統合を可能にしているため、研究分野への関心が高まった。
しかしながら、さまざまな医療画像の課題やタスクにおける事前ベース損失の多様性を考えると、どのデータセットに最適な損失を識別することが困難になっている。
本稿では,医療画像分割における最近の先行的損失のベンチマークについて述べる。
主な目的は、特定のタスクやデータセットに与えられた損失を選択するための直感を提供することである。
この目的のために、4つの低レベルおよび高レベルの事前ベース損失が選択される。
評価された損失は、Deathlon、ISLES、WMHチャレンジなど、さまざまな医療画像セグメンテーション課題から8つの異なるデータセットで検証される。
その結果、低レベルの事前ベース損失はデータセット特性に関わらずサイコロ損失ベースラインよりも性能が向上することを保証できるが、高レベルの事前ベース損失はデータ特性に応じて解剖学的信頼性が向上することが示された。
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