論文の概要: Multimodal HIE Lesion Segmentation in Neonates: A Comparative Study of Loss Functions
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2502.09148v1
- Date: Thu, 13 Feb 2025 10:23:45 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-02-14 13:48:20.805668
- Title: Multimodal HIE Lesion Segmentation in Neonates: A Comparative Study of Loss Functions
- Title(参考訳): 新生児におけるMultimodal HIE損傷分節 : ロス関数の比較検討
- Authors: Annayah Usman, Abdul Haseeb, Tahir Syed,
- Abstract要約: 我々は,データ制約を克服するための事前処理,拡張,トレーニング戦略を最適化した3次元U-Netを実装した。
本研究の目的は,HIE病変セグメンテーションタスクに特有な損失関数を同定することである。
Dice, Dice-Focal, Tversky, Hausdorff Distance (HausdorffDT) Loss と、Dice-Focal-HausdorffDT と Tversky-HausdorffDT の2つの複合的な損失によりセグメンテーション性能が向上した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License:
- Abstract: Segmentation of Hypoxic-Ischemic Encephalopathy (HIE) lesions in neonatal MRI is a crucial but challenging task due to diffuse multifocal lesions with varying volumes and the limited availability of annotated HIE lesion datasets. Using the BONBID-HIE dataset, we implemented a 3D U-Net with optimized preprocessing, augmentation, and training strategies to overcome data constraints. The goal of this study is to identify the optimal loss function specifically for the HIE lesion segmentation task. To this end, we evaluated various loss functions, including Dice, Dice-Focal, Tversky, Hausdorff Distance (HausdorffDT) Loss, and two proposed compound losses -- Dice-Focal-HausdorffDT and Tversky-HausdorffDT -- to enhance segmentation performance. The results show that different loss functions predict distinct segmentation masks, with compound losses outperforming standalone losses. Tversky-HausdorffDT Loss achieves the highest Dice and Normalized Surface Dice scores, while Dice-Focal-HausdorffDT Loss minimizes Mean Surface Distance. This work underscores the significance of task-specific loss function optimization, demonstrating that combining region-based and boundary-aware losses leads to more accurate HIE lesion segmentation, even with limited training data.
- Abstract(参考訳): 新生児MRIにおける低酸素性虚血性脳症 (HIE) 病変の分画は, 多焦点性病変が多量に分散し, 注釈付きHIE病変データセットが限られたため, 極めて重要な課題である。
BONBID-HIEデータセットを用いて,データ制約を克服するための事前処理,拡張,トレーニング戦略を最適化した3次元U-Netを実装した。
本研究の目的は,HIE病変セグメンテーションタスクに特有な損失関数を同定することである。
そこで我々は,Dice,Dice-Focal,Tversky,Hausdorff Distance (HausdorffDT) Loss,およびDice-Focal-HausdorffDTとTversky-HausdorffDTの2つの複合損失を,セグメント化性能を向上させるために評価した。
その結果, 異なる損失関数が別々のセグメンテーションマスクを予測し, 複合損失は単独の損失よりも優れていた。
Tversky-HausdorffDT Lossは、Dice and Normalized Surface Diceスコアを達成し、Dice-Focal-HausdorffDT Lossは平均表面距離を最小化する。
この研究は、タスク固有の損失関数最適化の重要性を強調し、領域ベースと境界認識の損失を組み合わせることで、限られたトレーニングデータであっても、より正確なHIE病変のセグメンテーションにつながることを示した。
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