論文の概要: Holistic Fine-grained GGS Characterization: From Detection to Unbalanced
Classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2202.00087v1
- Date: Mon, 31 Jan 2022 20:56:25 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-02-03 05:05:32.575166
- Title: Holistic Fine-grained GGS Characterization: From Detection to Unbalanced
Classification
- Title(参考訳): ホロスティックきめ細かいGGSの特徴:検出から不均衡分類へ
- Authors: Yuzhe Lu, Haichun Yang, Zuhayr Asad, Zheyu Zhu, Tianyuan Yao, Jiachen
Xu, Agnes B. Fogo, and Yuankai Huo
- Abstract要約: 完全自動で全スライド画像から糸球体硬化を定量化するための総括パイプラインを提案する。
本研究は,GGSを微粒化するためのオープンソースの定量的解析ツールである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.31092810561619
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Recent studies have demonstrated the diagnostic and prognostic values of
global glomerulosclerosis (GGS) in IgA nephropathy, aging, and end-stage renal
disease. However, the fine-grained quantitative analysis of multiple GGS
subtypes (e.g., obsolescent, solidified, and disappearing glomerulosclerosis)
is typically a resource extensive manual process. Very few automatic methods,
if any, have been developed to bridge this gap for such analytics. In this
paper, we present a holistic pipeline to quantify GGS (with both detection and
classification) from a whole slide image in a fully automatic manner. In
addition, we conduct the fine-grained classification for the sub-types of GGS.
Our study releases the open-source quantitative analytical tool for
fine-grained GGS characterization while tackling the technical challenges in
unbalanced classification and integrating detection and classification.
- Abstract(参考訳): 近年,IgA腎症,老化,末期腎疾患におけるグローバル糸球体硬化症の診断と予後について検討している。
しかしながら、複数のGGSサブタイプ(例えば、可溶化、固化、消滅する糸球体硬化症)の詳細な定量分析は、典型的にはリソースの広範囲な手作業である。
このような分析のためにこのギャップを埋めるために開発された自動手法はほとんどない。
本稿では,全スライド画像からGGS(検出と分類の両方)を完全自動で定量化するための全体的パイプラインを提案する。
さらに,GGSのサブタイプの詳細な分類を行う。
本研究は,非バランスな分類と検出と分類の統合という技術的課題に対処しながら,粒度GGSのキャラクタリゼーションを微粒化するためのオープンソースの定量的解析ツールをリリースする。
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