論文の概要: TorchMD-NET: Equivariant Transformers for Neural Network based Molecular
Potentials
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2202.02541v1
- Date: Sat, 5 Feb 2022 12:53:40 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-02-08 15:09:36.952253
- Title: TorchMD-NET: Equivariant Transformers for Neural Network based Molecular
Potentials
- Title(参考訳): TorchMD-NET:ニューラルネットワークに基づく分子ポテンシャルの等価変換器
- Authors: Philipp Th\"olke and Gianni De Fabritiis
- Abstract要約: 本稿では,新しい変圧器(ET)アーキテクチャであるTorchMD-NETを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.538209532048867
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The prediction of quantum mechanical properties is historically plagued by a
trade-off between accuracy and speed. Machine learning potentials have
previously shown great success in this domain, reaching increasingly better
accuracy while maintaining computational efficiency comparable with classical
force fields. In this work we propose TorchMD-NET, a novel equivariant
transformer (ET) architecture, outperforming state-of-the-art on MD17, ANI-1,
and many QM9 targets in both accuracy and computational efficiency. Through an
extensive attention weight analysis, we gain valuable insights into the black
box predictor and show differences in the learned representation of conformers
versus conformations sampled from molecular dynamics or normal modes.
Furthermore, we highlight the importance of datasets including off-equilibrium
conformations for the evaluation of molecular potentials.
- Abstract(参考訳): 量子力学特性の予測は歴史的に精度と速度のトレードオフによって苦しめられた。
機械学習のポテンシャルはこの領域で大きく成功し、古典的な力場に匹敵する計算効率を維持しながら、ますます精度が向上している。
本稿では,md17,ani-1,および多くのqm9ターゲットにおいて,精度と計算効率の両方において最先端を上回っている,新しい等価トランスフォーマー(et)アーキテクチャであるtorchmd-netを提案する。
広範に注目する重み解析により,ブラックボックス予測器について貴重な知見を得て,分子動力学や正常モードから採取したコンフォメーションとコンフォメーションの学習表現の違いを示す。
さらに,分子ポテンシャル評価のための非平衡コンフォーメーションを含むデータセットの重要性を強調した。
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