論文の概要: RestainNet: a self-supervised digital re-stainer for stain normalization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2202.13804v1
- Date: Mon, 28 Feb 2022 14:05:42 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-03-01 17:29:08.802627
- Title: RestainNet: a self-supervised digital re-stainer for stain normalization
- Title(参考訳): restainnet: 染色正規化のための自己監視型デジタル再ステイン
- Authors: Bingchao Zhao, Jiatai Lin, Changhong Liang, Zongjian Yi, Xin Chen,
Bingbing Li, Weihao Qiu, Danyi Li, Li Liang, Chu Han, and Zaiyi Liu
- Abstract要約: 染色正規化をデジタル再封止プロセスとして定式化し,RestainNetと呼ばれる自己教師型学習モデルを提案した。
我々のネットワークは、不安定な(グレースケール)イメージを再構成する方法を学ぶデジタル・リステナーと見なされている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.740191087897987
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Color inconsistency is an inevitable challenge in computational pathology,
which generally happens because of stain intensity variations or sections
scanned by different scanners. It harms the pathological image analysis
methods, especially the learning-based models. A series of approaches have been
proposed for stain normalization. However, most of them are lack flexibility in
practice. In this paper, we formulated stain normalization as a digital
re-staining process and proposed a self-supervised learning model, which is
called RestainNet. Our network is regarded as a digital restainer which learns
how to re-stain an unstained (grayscale) image. Two digital stains, Hematoxylin
(H) and Eosin (E) were extracted from the original image by Beer-Lambert's Law.
We proposed a staining loss to maintain the correctness of stain intensity
during the restaining process. Thanks to the self-supervised nature, paired
training samples are no longer necessary, which demonstrates great flexibility
in practical usage. Our RestainNet outperforms existing approaches and achieves
state-of-the-art performance with regard to color correctness and structure
preservation. We further conducted experiments on the segmentation and
classification tasks and the proposed RestainNet achieved outstanding
performance compared with SOTA methods. The self-supervised design allows the
network to learn any staining style with no extra effort.
- Abstract(参考訳): 色非一貫性は計算病理学において避けられない課題であり、一般的には染色強度の変化や異なるスキャナーでスキャンされた部分によって起こる。
病理画像解析手法、特に学習に基づくモデルに悪影響を及ぼす。
染色正規化のための一連のアプローチが提案されている。
しかし、そのほとんどは実際には柔軟性を欠いている。
本稿では,ステンド正規化をデジタル再保持プロセスとして定式化し,RestainNetと呼ばれる自己教師型学習モデルを提案する。
我々のネットワークは、未完の(グレースケールの)イメージを再維持する方法を学ぶデジタル・レステイナーとみなされている。
ヘマトキシリン(H)とエオシン(E)の2つのデジタル染色は、ベーア=ランベルトの法則により元の画像から抽出された。
残留過程における染色強度の正しさを維持するため,染色損失を提案した。
自己監督的な性質により、ペアトレーニングのサンプルはもはや不要となり、実用的な使用において大きな柔軟性が示される。
我々のRestainNetは既存のアプローチより優れており、色補正と構造保存に関して最先端のパフォーマンスを実現しています。
さらにセグメンテーションと分類タスクの実験を行い、提案したRestainNetはSOTA法と比較して優れた性能を示した。
自己監督設計により、ネットワークは余分な労力なしでステインスタイルを学べる。
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