論文の概要: Multi-Objective Latent Space Optimization of Generative Molecular Design Models

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2203.00526v2
• Date: Sat, 23 Dec 2023 00:33:49 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2023-12-28 02:20:19.948080
• Title: Multi-Objective Latent Space Optimization of Generative Molecular Design Models
• Title（参考訳）: 生成分子設計モデルの多目的潜在空間最適化
• Authors: A N M Nafiz Abeer, Nathan Urban, M Ryan Weil, Francis J. Alexander, Byung-Jun Yoon
• Abstract要約: 生成分子設計(GMD)の性能を大幅に向上させる多目的潜在空間最適化(LSO)法を提案する。 複数分子特性を共同最適化するための多目的GMD LSO法は, GMDの性能を著しく向上させることができることを示す。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 3.3903891679981597
• License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
• Abstract: Molecular design based on generative models, such as variational autoencoders (VAEs), has become increasingly popular in recent years due to its efficiency for exploring high-dimensional molecular space to identify molecules with desired properties. While the efficacy of the initial model strongly depends on the training data, the sampling efficiency of the model for suggesting novel molecules with enhanced properties can be further enhanced via latent space optimization. In this paper, we propose a multi-objective latent space optimization (LSO) method that can significantly enhance the performance of generative molecular design (GMD). The proposed method adopts an iterative weighted retraining approach, where the respective weights of the molecules in the training data are determined by their Pareto efficiency. We demonstrate that our multi-objective GMD LSO method can significantly improve the performance of GMD for jointly optimizing multiple molecular properties.
• Abstract（参考訳）: 可変オートエンコーダ(VAE)のような生成モデルに基づく分子設計は、高次元の分子空間を探索して所望の特性を持つ分子を同定する効率性から、近年人気が高まっている。 初期モデルの有効性はトレーニングデータに強く依存するが、改良された特性を持つ新規分子を提案するモデルのサンプリング効率は、潜在空間最適化によってさらに向上することができる。 本稿では、生成分子設計(GMD)の性能を大幅に向上させる多目的潜在空間最適化(LSO)手法を提案する。 提案手法では, トレーニングデータの各分子の重み付けがPareto効率によって決定される反復重み付け再学習手法を採用する。 複数分子特性を共同最適化するための多目的GMD LSO法により, GMDの性能を大幅に向上できることを示す。

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