論文の概要: SynthStrip: Skull-Stripping for Any Brain Image

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2203.09974v1
• Date: Fri, 18 Mar 2022 14:08:20 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2022-03-21 18:17:44.252417
• Title: SynthStrip: Skull-Stripping for Any Brain Image
• Title（参考訳）: SynthStrip:どんな脳画像でもスクリッピングできる
• Authors: Andrew Hoopes, Jocelyn S. Mora, Adrian V. Dalca, Bruce Fischl, Malte Hoffmann
• Abstract要約: 我々は,学習に基づく迅速な脳抽出ツールであるSynthStripを紹介した。 解剖学的セグメンテーションを活用することで、SynthStripは、解剖学、強度分布、および医療画像の現実的な範囲をはるかに超える人工的なトレーニングデータセットを生成する。 一般的な頭蓋骨切断ベースラインよりも精度が大幅に向上した。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 7.846209440615028
• License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
• Abstract: The removal of non-brain signal from magnetic resonance imaging (MRI) data, known as skull-stripping, is an integral component of many neuroimage analysis streams. Despite their abundance, popular classical skull-stripping methods are usually tailored to images with specific acquisition properties, namely near-isotropic resolution and T1-weighted (T1w) MRI contrast, which are prevalent in research settings. As a result, existing tools tend to adapt poorly to other image types, such as stacks of thick slices acquired with fast spin-echo (FSE) MRI that are common in the clinic. While learning-based approaches for brain extraction have gained traction in recent years, these methods face a similar burden, as they are only effective for image types seen during the training procedure. To achieve robust skull-stripping across a landscape of protocols, we introduce SynthStrip, a rapid, learning-based brain-extraction tool. By leveraging anatomical segmentations to generate an entirely synthetic training dataset with anatomies, intensity distributions, and artifacts that far exceed the realistic range of medical images, SynthStrip learns to successfully generalize to a variety of real acquired brain images, removing the need for training data with target contrasts. We demonstrate the efficacy of SynthStrip for a diverse set of image acquisitions and resolutions across subject populations, ranging from newborn to adult. We show substantial improvements in accuracy over popular skull-stripping baselines - all with a single trained model. Our method and labeled evaluation data are available at https://w3id.org/synthstrip.
• Abstract（参考訳）: 磁気共鳴画像(MRI)データからの非脳信号の除去は頭蓋骨ストリッピングと呼ばれ、多くの神経画像解析ストリームの不可欠な構成要素である。 その豊富さにもかかわらず、一般的な古典的な頭蓋骨切断法は、通常、特定の取得特性を持つ画像、すなわち、研究環境では一般的なT1強調(T1w)MRIコントラストに適合する。 その結果、既存のツールは、診療所で一般的なFSE(Fast spin-echo)MRIで取得した厚いスライスのスタックなど、他の画像タイプに適応しにくい傾向にある。 近年、学習に基づく脳抽出のアプローチが注目されているが、これらの手法は訓練中の画像タイプにのみ有効であるため、同様の負担に直面している。 プロトコルのランドスケープを横断する堅牢な頭蓋骨切断を実現するために,学習ベースの迅速な脳抽出ツールであるSynthStripを紹介した。 解剖学的セグメンテーションを活用して、解剖学、強度分布、および医療画像の現実的な範囲をはるかに超えた人工的なトレーニングデータセットを生成することで、SynthStripは、さまざまな実際の脳画像への一般化を成功させることを学び、ターゲットのコントラストによるトレーニングデータの必要性を取り除く。 本稿では,synthstripが新生児から成人まで多種多様な画像取得と解決に有効であることを示す。 一般的な頭蓋骨採取ベースラインよりも精度が大幅に向上しています。 当社のメソッドとラベル付き評価データは、https://w3id.org/synthstripで入手できます。

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