論文の概要: Multi-input segmentation of damaged brain in acute ischemic stroke
patients using slow fusion with skip connection
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2203.10039v1
- Date: Fri, 18 Mar 2022 16:26:53 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-03-21 13:47:16.397713
- Title: Multi-input segmentation of damaged brain in acute ischemic stroke
patients using slow fusion with skip connection
- Title(参考訳): 急性虚血性脳梗塞患者におけるスリー・フュージョンを用いた脳損傷のマルチインプットセグメンテーション
- Authors: Luca Tomasetti, Mahdieh Khanmohammadi, Kjersti Engan, Liv Jorunn
H{\o}llesli, and Kathinka D{\ae}hli Kurz
- Abstract要約: 急性虚血性脳梗塞患者における2つの虚血領域(コアとペナムブラ)を自動分割する方法を提案する。
我々のモデルは、マルチインプットと遅い融合を伴う畳み込み・デコンボリューションのボトルネック構造に基づいている。
提案したアーキテクチャは、神経放射線学者が注釈付けした地上の真実に匹敵する効果的な性能と結果を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.372466817835681
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Time is a fundamental factor during stroke treatments. A fast, automatic
approach that segments the ischemic regions helps treatment decisions. In
clinical use today, a set of color-coded parametric maps generated from
computed tomography perfusion (CTP) images are investigated manually to decide
a treatment plan. We propose an automatic method based on a neural network
using a set of parametric maps to segment the two ischemic regions (core and
penumbra) in patients affected by acute ischemic stroke. Our model is based on
a convolution-deconvolution bottleneck structure with multi-input and slow
fusion. A loss function based on the focal Tversky index addresses the data
imbalance issue. The proposed architecture demonstrates effective performance
and results comparable to the ground truth annotated by neuroradiologists. A
Dice coefficient of 0.81 for penumbra and 0.52 for core over the large vessel
occlusion test set is achieved. The full implementation is available at:
https://git.io/JtFGb.
- Abstract(参考訳): 脳卒中治療の基本因子は時間である。
虚血領域を分割する高速で自動的なアプローチは、治療決定に役立つ。
現在,CTP画像から得られたカラーコードパラメトリックマップを手作業で検討し,治療計画を決定する。
急性期脳卒中患者の2つの虚血領域(coreとpenumbra)を区分するパラメトリックマップを用いたニューラルネットワークを用いた自動手法を提案する。
我々のモデルは、マルチインプットと遅い融合を伴う畳み込み・デコンボリューションのボトルネック構造に基づいている。
focaltverskyインデックスに基づく損失関数は、データの不均衡問題に対処する。
提案するアーキテクチャは,神経放射線科医が注釈した根拠真理に匹敵する効果的な性能と結果を示している。
大型容器閉塞試験セット上でのペヌンブラのDice係数0.81、コアの0.52を実現する。
完全な実装はhttps://git.io/jtfgbで利用可能である。
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