論文の概要: Model Comparison in Approximate Bayesian Computation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2203.11276v1
- Date: Tue, 15 Mar 2022 10:24:16 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-03-27 05:13:26.922549
- Title: Model Comparison in Approximate Bayesian Computation
- Title(参考訳): 近似ベイズ計算におけるモデル比較
- Authors: Jan Boelts
- Abstract要約: 自然科学における一般的な問題は、観測されたデータに照らして競合するモデルの比較である。
この枠組みは、実際に使用されるほとんどのモデルにとって難解な確率関数の計算に依存している。
ABCにおけるベイズモデルの比較を行うための新しい効率的な手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.456877715768796
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: A common problem in natural sciences is the comparison of competing models in
the light of observed data. Bayesian model comparison provides a statistically
sound framework for this comparison based on the evidence each model provides
for the data. However, this framework relies on the calculation of likelihood
functions which are intractable for most models used in practice. Previous
approaches in the field of Approximate Bayesian Computation (ABC) circumvent
the evaluation of the likelihood and estimate the model evidence based on
rejection sampling, but they are typically computationally intense. Here, I
propose a new efficient method to perform Bayesian model comparison in ABC.
Based on recent advances in posterior density estimation, the method
approximates the posterior over models in parametric form. In particular, I
train a mixture-density network to map features of the observed data to the
posterior probability of the models. The performance is assessed with two
examples. On a tractable model comparison problem, the underlying exact
posterior probabilities are predicted accurately. In a use-case scenario from
computational neuroscience -- the comparison between two ion channel models --
the underlying ground-truth model is reliably assigned a high posterior
probability. Overall, the method provides a new efficient way to perform
Bayesian model comparison on complex biophysical models independent of the
model architecture.
- Abstract(参考訳): 自然科学における一般的な問題は、観測データの観点から競合するモデルの比較である。
ベイズモデルの比較は、各モデルがデータに対して与える証拠に基づいて、この比較に対して統計的に健全な枠組みを提供する。
しかし、この枠組みは、実際に使用されるほとんどのモデルにとって難解な確率関数の計算に依存している。
近似ベイズ計算(abc)の分野における以前のアプローチは、確率の評価を回避し、拒絶サンプリングに基づくモデル証拠を推定するが、通常は計算量的に強い。
本稿ではABCにおけるベイズモデルの比較を行うための新しい効率的な手法を提案する。
後方密度推定の最近の進歩に基づき、この手法はパラメトリックな形状の後方モデルに近似する。
特に、観測データの特徴をモデルの後方確率にマッピングするために、混合密度ネットワークを訓練します。
パフォーマンスは2つの例で評価されます。
移動可能なモデル比較問題において、正確な後方確率を正確に予測する。
計算神経科学のユースケースシナリオ -- 2つのイオンチャネルモデルの比較 -- では、基盤となる地対流モデルに高い後方確率が確実に割り当てられる。
全体として、この手法はモデルアーキテクチャに依存しない複雑な生体物理モデルに対するベイズモデルの比較を行うための新しい効率的な方法を提供する。
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