論文の概要: Automatic Identification of Chemical Moieties
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2203.16205v2
- Date: Thu, 27 Apr 2023 10:59:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-04-28 17:32:26.012583
- Title: Automatic Identification of Chemical Moieties
- Title(参考訳): 化学物質の自動同定
- Authors: Jonas Lederer, Michael Gastegger, Kristof T. Sch\"utt, Michael
Kampffmeyer, Klaus-Robert M\"uller, Oliver T. Unke
- Abstract要約: 本稿では, メッセージパッシングニューラルネットワークを用いて, 原子表現から化学量を自動的に同定する手法を提案する。
本手法の汎用性は, 化学データベースにおける代表成分の選択を可能にすることによって実証される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.50343898633327
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: In recent years, the prediction of quantum mechanical observables with
machine learning methods has become increasingly popular. Message-passing
neural networks (MPNNs) solve this task by constructing atomic representations,
from which the properties of interest are predicted. Here, we introduce a
method to automatically identify chemical moieties (molecular building blocks)
from such representations, enabling a variety of applications beyond property
prediction, which otherwise rely on expert knowledge. The required
representation can either be provided by a pretrained MPNN, or learned from
scratch using only structural information. Beyond the data-driven design of
molecular fingerprints, the versatility of our approach is demonstrated by
enabling the selection of representative entries in chemical databases, the
automatic construction of coarse-grained force fields, as well as the
identification of reaction coordinates.
- Abstract(参考訳): 近年,機械学習手法による量子力学的観測値の予測が盛んに行われている。
メッセージパッシングニューラルネットワーク(MPNN)は、関心の性質を予測する原子表現を構築することで、この課題を解決する。
本稿では,このような表現から化学運動量(分子構成要素)を自動的に識別する手法を提案する。
必要な表現は、事前訓練されたMPNNによって提供されるか、構造情報のみを使用してスクラッチから学習される。
分子指紋のデータ駆動設計の他に, 化学データベースにおける代表成分の選択, 粗粒界の自動構築, 反応座標の同定などにより, 本手法の汎用性を実証した。
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