論文の概要: KnowAugNet: Multi-Source Medical Knowledge Augmented Medication
Prediction Network with Multi-Level Graph Contrastive Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2204.11736v1
- Date: Mon, 25 Apr 2022 15:47:41 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-04-26 13:36:33.333232
- Title: KnowAugNet: Multi-Source Medical Knowledge Augmented Medication
Prediction Network with Multi-Level Graph Contrastive Learning
- Title(参考訳): knowaugnet:多レベルグラフコントラスト学習を用いた多元医療知識拡張薬理予測ネットワーク
- Authors: Yang An, Bo Jin, Xiaopeng Wei
- Abstract要約: 本稿では,マルチソース医療知識統合医薬品予測ネットワークである textbfKnowAugNet を提案する。
マルチレベルグラフコントラスト学習フレームワークを通じて、医療コード間の多様な関係をキャプチャする。
電子カルテに従って、医師が患者に通知された薬の判断を下すのを助けることができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.71936906687061
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Predicting medications is a crucial task in many intelligent healthcare
systems. It can assist doctors in making informed medication decisions for
patients according to electronic medical records (EMRs). However, medication
prediction is a challenging data mining task due to the complex relations
between medical codes. Most existing studies usually focus on mining the
temporal relations between medical codes while neglecting the valuable spatial
relations between heterogeneous or homogeneous medical codes, and the inherent
relations between homogeneous medical codes from hierarchical ontology graph,
which further limits the prediction performance. Therefore, to address these
limitations, this paper proposes \textbf{KnowAugNet}, a multi-sourced medical
knowledge augmented medication prediction network which can fully capture the
diverse relations between medical codes via multi-level graph contrastive
learning framework. Specifically, KnowAugNet first leverages the graph
contrastive learning using graph attention network as the encoder to capture
the implicit relations between homogeneous medical codes from the medical
ontology graph and obtains the knowledge augmented medical codes embedding
vectors. Then, it utilizes the graph contrastive learning using a weighted
graph convolutional network as the encoder to capture the correlative relations
between homogeneous or heterogeneous medical codes from the constructed medical
prior relation graph and obtains the relation augmented medical codes embedding
vectors. Finally, the augmented medical codes embedding vectors and the
supervised medical codes embedding vectors are retrieved and input to the
sequential learning network to capture the temporal relations of medical codes
and predict medications for patients.
- Abstract(参考訳): 医薬品の予測は多くの知的医療システムにおいて重要な課題である。
電子カルテ(EMR)に基づき、医師が患者の情報的治療決定を行うのを助けることができる。
しかし,医療コード間の複雑な関係から,投薬予測は困難なデータマイニング課題である。
既存の研究のほとんどは、不均質または均質な医療コード間の貴重な空間的関係を無視しながら、医療コード間の時間的関係のマイニングと、階層的オントロジーグラフからの均質な医療コード間の固有の関係にフォーカスしており、予測性能をさらに制限している。
そこで本稿では,多レベルグラフコントラスト学習フレームワークを用いて,医療コード間の多様な関係を完全に把握できる多元的医療知識拡張医薬品予測ネットワークである \textbf{knowaugnet} を提案する。
具体的には、まず、グラフアテンションネットワークをエンコーダとしてグラフコントラスト学習を利用して、医用オントロジーグラフから均質な医療コード間の暗黙的な関係を捉え、知識拡張医療コード埋め込みベクトルを得る。
次に、重み付きグラフ畳み込みネットワークをエンコーダとしてグラフコントラスト学習を行い、構築した医用事前関係グラフから均質または異質な医用コード間の相関関係を捉え、拡張された医用コード埋め込みベクトルの関係を得る。
最後に、拡張医療コード埋め込みベクターと教師付き医療コード埋め込みベクターを検索してシーケンシャルラーニングネットワークに入力し、医療コードの時間的関係を把握し、患者の薬剤を予測する。
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