論文の概要: RadioPathomics: Multimodal Learning in Non-Small Cell Lung Cancer for
Adaptive Radiotherapy
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2204.12423v1
- Date: Tue, 26 Apr 2022 16:32:52 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-04-27 12:36:50.280320
- Title: RadioPathomics: Multimodal Learning in Non-Small Cell Lung Cancer for
Adaptive Radiotherapy
- Title(参考訳): RadioPathomics: 適応放射線治療のための非小細胞肺癌のマルチモーダルラーニング
- Authors: Matteo Tortora, Ermanno Cordelli, Rosa Sicilia, Lorenzo Nibid, Edy
Ippolito, Giuseppe Perrone, Sara Ramella and Paolo Soda
- Abstract要約: 非小細胞肺癌に対する放射線治療成績を予測するため, マルチモーダルレイトフュージョン法を開発した。
実験により、AUCが90.9%ドルと同等のマルチモーダルパラダイムが、各ユニモーダルアプローチより優れていることが示された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.8161758803237067
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: The current cancer treatment practice collects multimodal data, such as
radiology images, histopathology slides, genomics and clinical data. The
importance of these data sources taken individually has fostered the recent
raise of radiomics and pathomics, i.e. the extraction of quantitative features
from radiology and histopathology images routinely collected to predict
clinical outcomes or to guide clinical decisions using artificial intelligence
algorithms. Nevertheless, how to combine them into a single multimodal
framework is still an open issue. In this work we therefore develop a
multimodal late fusion approach that combines hand-crafted features computed
from radiomics, pathomics and clinical data to predict radiation therapy
treatment outcomes for non-small-cell lung cancer patients. Within this
context, we investigate eight different late fusion rules (i.e. product,
maximum, minimum, mean, decision template, Dempster-Shafer, majority voting,
and confidence rule) and two patient-wise aggregation rules leveraging the
richness of information given by computer tomography images and whole-slide
scans. The experiments in leave-one-patient-out cross-validation on an in-house
cohort of 33 patients show that the proposed multimodal paradigm with an AUC
equal to $90.9\%$ outperforms each unimodal approach, suggesting that data
integration can advance precision medicine. As a further contribution, we also
compare the hand-crafted representations with features automatically computed
by deep networks, and the late fusion paradigm with early fusion, another
popular multimodal approach. In both cases, the experiments show that the
proposed multimodal approach provides the best results.
- Abstract(参考訳): 現在のがん治療プラクティスは、放射線画像、病理組織学スライド、ゲノム、臨床データなどのマルチモーダルデータを収集する。
これらのデータソースの重要性は、放射線学と病理学の最近の隆盛、すなわち臨床結果を予測するために定期的に収集された放射線学と病理学画像からの定量的特徴の抽出、または人工知能アルゴリズムを用いた臨床判断の指導を助長した。
それでも、それらを単一のマルチモーダルフレームワークに統合する方法は、まだ未解決の問題である。
そこで本研究では,非小細胞肺癌患者に対する放射線治療成績を予測するために,放射線学,病理学,臨床データから計算した手作り特徴を組み合わせたマルチモーダルレイトフュージョン法を開発した。
この文脈では,8種類の後期融合規則(製品,最大,最小,平均,決定テンプレート,デンプスター・シェーファー,多数決,信頼ルール)と,コンピュータ断層画像と全スライディングスキャンから得られる情報の豊かさを活用する2つの患者関連集約規則について検討する。
33例の家庭内コホートにおける非患者間相互評価実験により, auc が 90.9\%$ のマルチモーダルパラダイムが各ユニモーダルアプローチを上回っており,データ統合が精密医学を進歩させる可能性が示唆された。
さらに,手作り表現とディープネットワークで自動的に計算される特徴,後期融合パラダイムと,他の一般的なマルチモーダルアプローチであるearly fusionとの比較を行った。
いずれの場合においても,提案するマルチモーダルアプローチが最良の結果をもたらすことを示す実験を行った。
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