論文の概要: Semi-self-supervised Automated ICD Coding
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2205.10088v1
- Date: Fri, 20 May 2022 11:12:54 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-05-23 23:08:29.987169
- Title: Semi-self-supervised Automated ICD Coding
- Title(参考訳): 半教師付き自動icd符号化
- Authors: Hlynur D. Hlynsson, Steind\'or Ellertsson, J\'on F. Da{\dh}ason, Emil
L. Sigurdsson, Hrafn Loftsson
- Abstract要約: 臨床用テキストノート (CTN) には、医師が患者を診察しインタビューする際に、構造化されていない自由テキスト形式で書かれた推論プロセスが含まれている。
本稿では,アイスランドのCTNの希少な注釈付きデータセットを,機械学習型計算で半自己管理的に拡張する方法を提案する。
我々は、注釈付きCTNの小さなセットでニューラルネットワークをトレーニングし、アノテーションなしCTNのセットから臨床特徴を抽出する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.449909275410288
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Clinical Text Notes (CTNs) contain physicians' reasoning process, written in
an unstructured free text format, as they examine and interview patients. In
recent years, several studies have been published that provide evidence for the
utility of machine learning for predicting doctors' diagnoses from CTNs, a task
known as ICD coding. Data annotation is time consuming, particularly when a
degree of specialization is needed, as is the case for medical data. This paper
presents a method of augmenting a sparsely annotated dataset of Icelandic CTNs
with a machine-learned imputation in a semi-self-supervised manner. We train a
neural network on a small set of annotated CTNs and use it to extract clinical
features from a set of un-annotated CTNs. These clinical features consist of
answers to about a thousand potential questions that a physician might find the
answers to during a consultation of a patient. The features are then used to
train a classifier for the diagnosis of certain types of diseases. We report
the results of an evaluation of this data augmentation method over three tiers
of data availability to the physician. Our data augmentation method shows a
significant positive effect which is diminished when clinical features from the
examination of the patient and diagnostics are made available. We recommend our
method for augmenting scarce datasets for systems that take decisions based on
clinical features that do not include examinations or tests.
- Abstract(参考訳): 臨床用テキストノート (CTN) には、医師が患者を診察しインタビューする際に、構造化されていない自由テキスト形式で書かれた推論プロセスが含まれている。
近年、icdコーディングとして知られる課題であるctnsから医師の診断を予測するために機械学習が有用であることを示すいくつかの研究が公表されている。
データアノテーションは、特に医療データの場合のように、専門化の程度が必要な場合には、時間がかかります。
本稿では,アイスランドのCTNの希少な注釈付きデータセットを,機械学習型計算で半自己管理的に拡張する方法を提案する。
我々は、注釈付きCTNの小さなセットでニューラルネットワークをトレーニングし、アノテーションなしCTNのセットから臨床特徴を抽出する。
これらの臨床的特徴は、医師が患者の相談中に答えを見つける可能性のある1000の潜在的な質問に対する回答から成り立っている。
この特徴は、特定の種類の疾患の診断のために分類器を訓練するために使用される。
本稿では,このデータ拡張法を医師に3層にわたって評価した結果について報告する。
データ拡張法では,患者の診査や診断からの臨床所見が得られれば,有意な有意な有意な効果が示される。
我々は,検査や検査を含まない臨床特徴に基づいて意思決定を行うシステムに対して,不足データセットを増大させる手法を推奨する。
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