論文の概要: Metrics reloaded: Pitfalls and recommendations for image analysis
validation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2206.01653v1
- Date: Fri, 3 Jun 2022 15:56:51 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-06-06 14:43:15.575428
- Title: Metrics reloaded: Pitfalls and recommendations for image analysis
validation
- Title(参考訳): メトリクスの再ロード:画像解析検証のための落とし穴と推奨
- Authors: Lena Maier-Hein, Annika Reinke, Evangelia Christodoulou, Ben Glocker,
Patrick Godau, Fabian Isensee, Jens Kleesiek, Michal Kozubek, Mauricio Reyes,
Michael A. Riegler, Manuel Wiesenfarth, Michael Baumgartner, Matthias
Eisenmann, Doreen Heckmann-N\"otzel, A. Emre Kavur, Tim R\"adsch, Minu D.
Tizabi, Laura Acion, Michela Antonelli, Tal Arbel, Spyridon Bakas, Peter
Bankhead, Arriel Benis, M. Jorge Cardoso, Veronika Cheplygina, Beth Cimini,
Gary S. Collins, Keyvan Farahani, Bram van Ginneken, Daniel A. Hashimoto,
Michael M. Hoffman, Merel Huisman, Pierre Jannin, Charles E. Kahn, Alexandros
Karargyris, Alan Karthikesalingam, Hannes Kenngott, Annette Kopp-Schneider,
Anna Kreshuk, Tahsin Kurc, Bennett A. Landman, Geert Litjens, Amin Madani,
Klaus Maier-Hein, Anne L. Martel, Peter Mattson, Erik Meijering, Bjoern
Menze, David Moher, Karel G.M. Moons, Henning M\"uller, Felix Nickel, Brennan
Nichyporuk, Jens Petersen, Nasir Rajpoot, Nicola Rieke, Julio Saez-Rodriguez,
Clarisa S\'anchez Guti\'errez, Shravya Shetty, Maarten van Smeden, Carole H.
Sudre, Ronald M. Summers, Abdel A. Taha, Sotirios A. Tsaftaris, Ben Van
Calster, Ga\"el Varoquaux, Paul F. J\"ager
- Abstract要約: 本稿では、研究者が問題意識でパフォーマンス指標を選択するための総合的なフレームワークを提案する。
このフレームワークはまず、与えられた問題の出力関連特性を問題指紋にコンパイルする。
次に、ユーザに対して、適切な検証メトリクスを選択して適用するプロセスを通じて、個々の選択に関連する潜在的な落とし穴を認識しながら、ユーザをガイドする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 51.419706826112716
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The field of automatic biomedical image analysis crucially depends on robust
and meaningful performance metrics for algorithm validation. Current metric
usage, however, is often ill-informed and does not reflect the underlying
domain interest. Here, we present a comprehensive framework that guides
researchers towards choosing performance metrics in a problem-aware manner.
Specifically, we focus on biomedical image analysis problems that can be
interpreted as a classification task at image, object or pixel level. The
framework first compiles domain interest-, target structure-, data set- and
algorithm output-related properties of a given problem into a problem
fingerprint, while also mapping it to the appropriate problem category, namely
image-level classification, semantic segmentation, instance segmentation, or
object detection. It then guides users through the process of selecting and
applying a set of appropriate validation metrics while making them aware of
potential pitfalls related to individual choices. In this paper, we describe
the current status of the Metrics Reloaded recommendation framework, with the
goal of obtaining constructive feedback from the image analysis community. The
current version has been developed within an international consortium of more
than 60 image analysis experts and will be made openly available as a
user-friendly toolkit after community-driven optimization.
- Abstract(参考訳): 自動バイオメディカル画像解析の分野は、アルゴリズム検証のためのロバストで有意義なパフォーマンス指標に依存する。
しかし、現在のメートル法の使用はしばしば不正であり、基礎となるドメインの関心を反映していない。
本稿では、研究者が問題意識でパフォーマンス指標を選択するための包括的なフレームワークを提案する。
具体的には,画像,物体,画素レベルでの分類課題として解釈できる生体画像解析問題に焦点を当てる。
このフレームワークはまず、与えられた問題のドメイン関心、対象構造、データセット、アルゴリズム出力関連特性を問題指紋にコンパイルすると同時に、イメージレベルの分類、セマンティックセグメンテーション、インスタンスセグメンテーション、オブジェクト検出といった適切な問題カテゴリにマッピングする。
次に、ユーザに対して、適切な検証メトリクスを選択して適用するプロセスを通じて、個々の選択に関連する潜在的な落とし穴を認識させる。
本稿では,画像解析コミュニティからコンストラクティブなフィードバックを得ることを目的として,メトリクスリロードされたレコメンデーションフレームワークの現状について述べる。
現在のバージョンは60人以上の画像分析専門家による国際コンソーシアムで開発されており、コミュニティ主導の最適化の後、ユーザフレンドリーなツールキットとして公開される予定だ。
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