論文の概要: Bootstrapping Semi-supervised Medical Image Segmentation with
Anatomical-aware Contrastive Distillation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2206.02307v1
- Date: Mon, 6 Jun 2022 01:30:03 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-06-08 06:23:28.716757
- Title: Bootstrapping Semi-supervised Medical Image Segmentation with
Anatomical-aware Contrastive Distillation
- Title(参考訳): anatomical-aware contrastive distillation による半教師付き医用画像分割
- Authors: Chenyu You, Weicheng Dai, Lawrence Staib, James S. Duncan
- Abstract要約: 半教師型医用画像セグメンテーションのための解剖学的認識型ConTrastive dIstillatiONフレームワークであるACTIONを提案する。
まず, 正対と負対の2値監督ではなく, 負対をソフトにラベル付けして, 反復的コントラスト蒸留法を開発した。
また、サンプルデータの多様性を強制するために、ランダムに選択された負の集合から、より意味論的に類似した特徴を抽出する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 10.877450596327407
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Contrastive learning has shown great promise over annotation scarcity
problems in the context of medical image segmentation. Existing approaches
typically assume a balanced class distribution for both labeled and unlabeled
medical images. However, medical image data in reality is commonly imbalanced
(i.e., multi-class label imbalance), which naturally yields blurry contours and
usually incorrectly labels rare objects. Moreover, it remains unclear whether
all negative samples are equally negative. In this work, we present ACTION, an
Anatomical-aware ConTrastive dIstillatiON framework, for semi-supervised
medical image segmentation. Specifically, we first develop an iterative
contrastive distillation algorithm by softly labeling the negatives rather than
binary supervision between positive and negative pairs. We also capture more
semantically similar features from the randomly chosen negative set compared to
the positives to enforce the diversity of the sampled data. Second, we raise a
more important question: Can we really handle imbalanced samples to yield
better performance? Hence, the key innovation in ACTION is to learn global
semantic relationship across the entire dataset and local anatomical features
among the neighbouring pixels with minimal additional memory footprint. During
the training, we introduce anatomical contrast by actively sampling a sparse
set of hard negative pixels, which can generate smoother segmentation
boundaries and more accurate predictions. Extensive experiments across two
benchmark datasets and different unlabeled settings show that ACTION performs
comparable or better than the current state-of-the-art supervised and
semi-supervised methods. Our code and models will be publicly available.
- Abstract(参考訳): 医用画像セグメンテーションの文脈におけるアノテーション不足問題に対して,コントラスト学習は大きな可能性を秘めている。
既存のアプローチは通常、ラベル付きおよびラベルなしの医療画像のバランスの取れたクラス分布を仮定する。
しかし、現実の医用画像データは一般に不均衡(すなわち多種ラベル不均衡)であり、自然にぼやけた輪郭を生じさせ、通常不正確に珍しい物体をラベル付けする。
さらに、全ての負のサンプルが等しく負であるかどうかも不明である。
本稿では,解剖学的に認識されたConTrastive dIstillationフレームワークであるACTIONについて紹介する。
具体的には, 正対と負対の二元的監督ではなく, 緩やかに負のラベルを付けて, 反復的コントラスト蒸留アルゴリズムを開発した。
また、サンプルデータの多様性を強制するために、ランダムに選択された負の集合からより意味論的に類似した特徴を抽出する。
第2に,より重要な疑問を提起する – パフォーマンス向上のために,本当に不均衡なサンプルを扱うことができるのか?
したがって、ACTIONの重要なイノベーションは、データセット全体にわたるグローバルなセマンティックな関係と、最小限の追加メモリフットプリントを持つ近隣ピクセル間の局所的な解剖学的特徴を学ぶことである。
トレーニング中,我々は,よりスムーズなセグメンテーション境界とより正確な予測を生成できる,粗い負画素の集合を積極的にサンプリングすることで解剖学的コントラストを導入する。
2つのベンチマークデータセットと異なるラベル付き設定による広範囲な実験は、アクションが現在の最先端の教師付きおよび半教師付きメソッドと同等かそれ以上であることを示している。
私たちのコードとモデルは公開されます。
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