論文の概要: Constrained Submodular Optimization for Vaccine Design
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2206.08336v1
- Date: Thu, 16 Jun 2022 17:40:54 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-06-17 16:59:46.514932
- Title: Constrained Submodular Optimization for Vaccine Design
- Title(参考訳): ワクチン設計のための制約付きサブモジュラー最適化
- Authors: Zheng Dai, David Gifford
- Abstract要約: 遺伝的変異により、接種された集団に広範な免疫を与えるペプチドワクチンを設計することが困難になる。
本稿では,確率論的機械学習モデルを用いたペプチドワクチンの評価と設計のためのフレームワークを提案する。
従来より優れたSARS-CoV-2ワクチンの設計を行う能力を示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.7622426179653559
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Advances in machine learning have enabled the prediction of immune system
responses to prophylactic and therapeutic vaccines. However, the engineering
task of designing vaccines remains a challenge. In particular, the genetic
variability of the human immune system makes it difficult to design peptide
vaccines that provide widespread immunity in vaccinated populations. We
introduce a framework for evaluating and designing peptide vaccines that uses
probabilistic machine learning models, and demonstrate its ability to produce
designs for a SARS-CoV-2 vaccine that outperform previous designs. We provide a
theoretical analysis of the approximability, scalability, and complexity of our
framework.
- Abstract(参考訳): 機械学習の進歩により、予防および治療ワクチンに対する免疫系の反応の予測が可能になった。
しかし、ワクチンを設計する工学的課題は依然として課題である。
特に、ヒト免疫系の遺伝的多様性は、接種された集団に広範な免疫を与えるペプチドワクチンの設計を困難にしている。
本稿では,確率的機械学習モデルを用いたペプチドワクチンの評価と設計の枠組みを紹介し,従来よりも優れたsars-cov-2ワクチンの設計能力を示す。
我々は、フレームワークの近似可能性、拡張性、複雑さに関する理論的分析を提供する。
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