論文の概要: Lesion-Aware Contrastive Representation Learning for Histopathology
Whole Slide Images Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2206.13115v1
- Date: Mon, 27 Jun 2022 08:39:51 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-06-28 15:08:49.244227
- Title: Lesion-Aware Contrastive Representation Learning for Histopathology
Whole Slide Images Analysis
- Title(参考訳): 全スライド画像解析のための病変認識コントラスト表現学習
- Authors: Jun Li, Yushan Zheng, Kun Wu, Jun Shi, Fengying Xie, Zhiguo Jiang
- Abstract要約: 本稿では,スライド画像解析の病理組織学的手法として,Lesion-Aware Contrastive Learning (LACL) という新しいコントラスト表現学習フレームワークを提案する。
実験の結果,LACLは異なるデータセット上での組織像表現学習において,最高の性能を発揮することが示された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 16.264758789726223
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Local representation learning has been a key challenge to promote the
performance of the histopathological whole slide images analysis. The previous
representation learning methods followed the supervised learning paradigm.
However, manual annotation for large-scale WSIs is time-consuming and
labor-intensive. Hence, the self-supervised contrastive learning has recently
attracted intensive attention. The present contrastive learning methods treat
each sample as a single class, which suffers from class collision problems,
especially in the domain of histopathology image analysis. In this paper, we
proposed a novel contrastive representation learning framework named
Lesion-Aware Contrastive Learning (LACL) for histopathology whole slide image
analysis. We built a lesion queue based on the memory bank structure to store
the representations of different classes of WSIs, which allowed the contrastive
model to selectively define the negative pairs during the training. Moreover,
We designed a queue refinement strategy to purify the representations stored in
the lesion queue. The experimental results demonstrate that LACL achieves the
best performance in histopathology image representation learning on different
datasets, and outperforms state-of-the-art methods under different WSI
classification benchmarks. The code is available at
https://github.com/junl21/lacl.
- Abstract(参考訳): 局所表現学習は病理組織学的全スライド画像解析の性能向上に重要な課題である。
従来の表現学習方法は教師付き学習パラダイムに従っていた。
しかし、大規模wsisの手動アノテーションは時間と労力がかかる。
そのため,近年,自己指導型コントラスト学習が注目されている。
本研究の対比学習法は,各試料を1つのクラスとして扱い,特に病理組織学画像解析の領域において,クラス衝突問題に苦しむ。
本稿では,スライド画像解析における病理組織学全体を対象とした,LACL(Lesion-Aware Contrastive Learning)という新しいコントラスト学習フレームワークを提案する。
WSIの異なるクラスの表現を格納するために、メモリバンク構造に基づく障害キューを構築しました。
さらに,病巣キューに格納された表現を純化するために,キューリファインメント戦略を考案した。
実験の結果, LACLは, 異なるデータセット上での組織像表現学習において最高の性能を示し, 異なるWSI分類ベンチマークで最先端の手法より優れていた。
コードはhttps://github.com/junl21/laclで入手できる。
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