論文の概要: A Few-shot Learning Graph Multi-Trajectory Evolution Network for
Forecasting Multimodal Baby Connectivity Development from a Baseline
Timepoint
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2110.03535v1
- Date: Wed, 6 Oct 2021 08:26:57 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-10-08 15:50:13.452883
- Title: A Few-shot Learning Graph Multi-Trajectory Evolution Network for
Forecasting Multimodal Baby Connectivity Development from a Baseline
Timepoint
- Title(参考訳): ベースラインタイムポイントからのマルチモーダルベビー接続性開発予測のための数ショット学習グラフ多軌道進化ネットワーク
- Authors: Alaa Bessadok, Ahmed Nebli, Mohamed Ali Mahjoub, Gang Li, Weili Lin,
Dinggang Shen and Islem Rekik
- Abstract要約: 本稿では,教師-学生パラダイムを取り入れたグラフ多目的進化ネットワーク(GmTE-Net)を提案する。
これは、脳グラフ多軌道成長予測に適した最初の教師学生アーキテクチャである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 53.73316520733503
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Charting the baby connectome evolution trajectory during the first year after
birth plays a vital role in understanding dynamic connectivity development of
baby brains. Such analysis requires acquisition of longitudinal connectomic
datasets. However, both neonatal and postnatal scans are rarely acquired due to
various difficulties. A small body of works has focused on predicting baby
brain evolution trajectory from a neonatal brain connectome derived from a
single modality. Although promising, large training datasets are essential to
boost model learning and to generalize to a multi-trajectory prediction from
different modalities (i.e., functional and morphological connectomes). Here, we
unprecedentedly explore the question: Can we design a few-shot learning-based
framework for predicting brain graph trajectories across different modalities?
To this aim, we propose a Graph Multi-Trajectory Evolution Network (GmTE-Net),
which adopts a teacher-student paradigm where the teacher network learns on
pure neonatal brain graphs and the student network learns on simulated brain
graphs given a set of different timepoints. To the best of our knowledge, this
is the first teacher-student architecture tailored for brain graph
multi-trajectory growth prediction that is based on few-shot learning and
generalized to graph neural networks (GNNs). To boost the performance of the
student network, we introduce a local topology-aware distillation loss that
forces the predicted graph topology of the student network to be consistent
with the teacher network. Experimental results demonstrate substantial
performance gains over benchmark methods. Hence, our GmTE-Net can be leveraged
to predict atypical brain connectivity trajectory evolution across various
modalities. Our code is available at https: //github.com/basiralab/GmTE-Net.
- Abstract(参考訳): 出生後1年間の赤ちゃんコネクトーム進化の軌跡は、赤ちゃんの脳のダイナミックな結合性発達を理解する上で重要な役割を担っている。
このような分析は、長手接続データセットの取得を必要とする。
しかし、新生児スキャンも生後スキャンも様々な困難から取得されることはほとんどない。
少数の研究は、単一モダリティに由来する新生児脳コネクトームから脳の進化軌道を予測することに重点を置いている。
有望ではあるが、大規模なトレーニングデータセットはモデル学習を促進し、異なるモーダル(機能的および形態的コネクトーム)から多軌道予測に一般化するために不可欠である。
異なるモードで脳グラフの軌跡を予測するための、数ショットの学習ベースのフレームワークを設計できるだろうか?
そこで本研究では,教師ネットワークが純粋に新生児脳グラフを学習し,学生ネットワークが様々な時間ポイントを与えられたシミュレーション脳グラフを学習する教師学習パラダイムを取り入れたグラフ多軌道進化ネットワーク(gmte-net)を提案する。
我々の知る限りでは、これは脳グラフ多軌道成長予測に適した最初の教師学生アーキテクチャであり、少数ショット学習に基づいてグラフニューラルネットワーク(GNN)に一般化されている。
学生ネットワークの性能を高めるために,生徒ネットワークの予測グラフトポロジーを教師ネットワークと整合させる局所トポロジー対応蒸留損失を導入する。
実験により, ベンチマーク法よりもかなりの性能向上を示した。
したがって、我々のGmTE-Netは、様々なモードにわたる非定型的な脳接続軌道の進化を予測するために利用することができる。
私たちのコードはhttps: //github.com/basiralab/GmTE-Netで利用可能です。
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