論文の概要: Learning Topological Interactions for Multi-Class Medical Image
Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2207.09654v1
- Date: Wed, 20 Jul 2022 05:09:43 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-07-21 13:31:38.643851
- Title: Learning Topological Interactions for Multi-Class Medical Image
Segmentation
- Title(参考訳): 多クラス医用画像分割のためのトポロジカルインタラクションの学習
- Authors: Saumya Gupta, Xiaoling Hu, James Kaan, Michael Jin, Mutshipay Mpoy,
Katherine Chung, Gagandeep Singh, Mary Saltz, Tahsin Kurc, Joel Saltz,
Apostolos Tassiopoulos, Prateek Prasanna, Chao Chen
- Abstract要約: 我々は、トポロジカル相互作用をディープニューラルネットワークにエンコードする新しいトポロジカル相互作用モジュールを導入する。
実装は完全に畳み込みベースなので、非常に効率的です。
本手法は,プロプライエタリデータセットとパブリックデータセットの両方において一般化可能であることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.95994513875072
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Deep learning methods have achieved impressive performance for multi-class
medical image segmentation. However, they are limited in their ability to
encode topological interactions among different classes (e.g., containment and
exclusion). These constraints naturally arise in biomedical images and can be
crucial in improving segmentation quality. In this paper, we introduce a novel
topological interaction module to encode the topological interactions into a
deep neural network. The implementation is completely convolution-based and
thus can be very efficient. This empowers us to incorporate the constraints
into end-to-end training and enrich the feature representation of neural
networks. The efficacy of the proposed method is validated on different types
of interactions. We also demonstrate the generalizability of the method on both
proprietary and public challenge datasets, in both 2D and 3D settings, as well
as across different modalities such as CT and Ultrasound. Code is available at:
https://github.com/TopoXLab/TopoInteraction
- Abstract(参考訳): 深層学習法はマルチクラスの医用画像セグメンテーションにおいて優れた性能を発揮している。
しかし、それらは異なるクラス(例えば、封じ込めと排除)間の位相的相互作用をエンコードする能力に制限がある。
これらの制約は自然に生体画像に現れ、セグメンテーションの品質向上に不可欠である。
本稿では,トポロジカル相互作用を深層ニューラルネットワークにエンコードする新しいトポロジカル相互作用モジュールを提案する。
実装は完全に畳み込みベースであり、非常に効率的である。
これにより、制約をエンドツーエンドのトレーニングに取り入れ、ニューラルネットワークの機能表現を強化することができます。
提案手法の有効性は相互作用の種類によって検証される。
また, プロプライエタリおよびパブリックな課題データセット, 2次元および3次元設定, およびCTやUltrasoundなどの様々なモダリティにおいて, この手法の一般化可能性を示す。
コードは、https://github.com/TopoXLab/TopoInteractionで入手できる。
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